Kültürlerin doğal olarak idrar ve genital yollar içerisinde bulunduğundan, semende bakteri varlığı normal olarak kabul edilir. Bazı durumlarda bu sağlıklı bakteriler kontrolden çıkıp enfeksiyona yol açabilir. Penisin veya prostatın içindeki bir enfeksiyon, menide yüksek bakteri seviyelerine neden olabilir. Enfekte bir eşle seks yapmak aynı zamanda genital veya idrar yollarında da enfeksiyona yol açabilir, bunun gerçekleşmesi daha az olasıdır.
Tüm sağlıklı erkeklerin spermlerinde bir bakteri seviyesi vardır. Bu normal olarak oluşan flora, üreme ve idrar yollarında kolonileşir ve tipik olarak herhangi bir zarara neden olmaz. Sünnetli olmayan erkeklerde bakteri sünnet derisinin arkasında kolonileşebilir. Bu bakterilerin aşırı büyümesi, uygun hijyen ile önlenebilir. Ön ayaklarının arkasını doğru yıkamayanlar, idrar yolu enfeksiyonu veya semenlerindeki ortalama bakteri sayısından daha fazla olabilir.
Bakterilerin kolonileşmesi bir enfeksiyon olarak kabul edilmez. Bir enfeksiyon tipik olarak idrar sıklığı veya aciliyet gibi ek semptomlarla ilgilidir. Enfeksiyonun diğer belirtileri arasında penisten ateş, irin veya kan, sıra dışı akıntı veya ağrı vardır. Bazen bilinen bir enfeksiyon nedeni yoktur. Normal bakteriler, hormonal sorunlar, olağandışı stres veya başka bir hastalık dahil olmak üzere birçok nedenden dolayı normalden daha hızlı büyüyebilir.
Menide büyük miktarlarda bakteri ayrıca, enfekte bir eşle seks yoluyla enfeksiyondan da kaynaklanabilir. Bakteriyel vajinal enfeksiyonu olan kadınlar, cinsel bakteri yoluyla zararlı bakterileri yayabilir. Bu, çoğunlukla virüslerin neden olduğu cinsel yolla bulaşan hastalıklar ile aynı olarak kabul edilmez. Bu gerçekleştiğinde, erkekler genellikle bir enfeksiyonun belirtilerini fark eder. Genelde doktor, menide bakteri tespit eden kişidir.
Prostat şişmesi de enfeksiyona neden olabilir, çünkü şişmiş prostat bezi tam idrara çıkmaya izin vermez. Bakterilerin mesanenin içinde büyümesine izin verilir ve daha sonra genital kanallara geçebilir. Bu durum yaşlı erkeklerde çok daha yaygındır, çünkü genişlemiş prostatlara meyillidirler.
Çoğu durumda, menide bol miktarda bakteri tedavisi antibiyotik ilaç kullanımını içerir. Kullanılan tam ilaç tipi, mevcut bakteri türüne bağlı olacaktır. Nadir durumlarda, sünnetsiz bir erkek, eğer bakteriler sünnet derisinin kendisinin altındaki bir aşırı büyümeden kaynaklanırsa, tekrarlayan enfeksiyon nedeniyle sünnetini çıkarabilir. Bu, uygun hijyen uygulayan erkeklerde nadir görülür. Büyümüş prostatlı erkeklere genellikle şişliği azaltmak için ilaç verilir ve altta yatan prostat koşulları da tedavi edilebilir.


