Disleksi nedenleri henüz tam olarak anlaşılmamıştır, ancak büyük ölçüde kalıtsal olduğuna inanılmaktadır. Disleksi'nin diğer nedenleri, erken çocukluk döneminde çok küçük çocukların uygun kelime ve harf seslerini yanlış anlamalarına neden olabilecek işitme bozukluğunu içerebilir. Bazı uzmanlar, disleksinin beynin yapılandırılmasındaki veya işlevlerindeki farklılıklar nedeniyle meydana geldiğine inanmaktadır. Disleksi olan kişilerin beyinleri, beynin sağ tarafında sözlü ve yazılı dili işlemeye çalışırken, disleksi bulunmayan kişilerin beyinleri sol tarafta dili işlemeye çalışır. Diğerleri, disleksinin beynin bir bütün olarak basit bir şekilde şekillenmediğinde meydana geldiğine veya tüm bu faktörlerin bir kombinasyonunun disleksiden sorumlu olabileceğine inanır.
Bazı uzmanlar, çok küçük çocuklarda işitme bozukluğunun disleksiden muzdarip olabileceğini düşünüyor. Bu teorinin argümanı, bu küçük çocukların dil seslerini özümseyip yanlış yorumladıkları ve harflerini doğru sesleriyle eşleştirmede sorun yaşayabilecekleridir.
Diğerleri beyin gelişimi veya işleyişiyle ilgili sorunların disleksinin başlıca nedenleri arasında olduğuna inanmaktadır. Bazı araştırmacılar disleksi olan insanların beyninin uygun şekilde şekillenmediğini, bu nedenle dilin normal bir şekilde anlaşılması için gerekli sinirsel bağlantıların kurulmadığını düşünüyor. Yine de diğerleri, disleksi olan insanların beyninin dili beynin sağ tarafında yorumlamaya çalıştığını düşünüyor. Normal insan beyinlerinin beynin sol tarafındaki dili yorumladığına inanılmaktadır, bu nedenle, sağ beynini dili yorumlamak için kullanan kişi önemli bir dezavantaja sahip olabilir.
Kalıtımın, disleksinin birincil sebeplerinden biri olduğuna inanılmaktadır. Araştırmacılar, bu durumun gelişiminde bir gen kombinasyonunun olabileceğine inanmaktadır. Ayrıca, bu rahatsızlığı olan kişilerin aynı ikizlerinin, aynı zamanda bundan da zarar görmeleri çok muhtemeldir. Disleksi olan kişilerin genellikle bir ebeveyni, büyükanne veya büyükbabası, teyzesi, amcası ya da engelli bir kardeşi olması çok olasıdır. Ancak birçok araştırmacı, disleksi nedenlerinin gizemli olduğunu ve bu faktörlerin bir kısmının veya tamamının ve henüz tanımlanmayan faktörlerin durumdan sorumlu olabileceğini kabul ediyor.
