Patojen bakteri hastalığa neden olan bakteridir. İnsanlar genellikle en çok insanlarda hastalığa neden olabilecek patojenik bakteri türleri ile ilgilenirler, ancak bu bakteriler diğer hayvanları ve bitkileri de enfekte edebilir. Dikkate değer bazı patojen bakteriler arasında diğerleri arasında Streptococcus, Staphylococcus, Tüberküloz ve Escherichia coli bulunur. Dünya çapında bu bakteriler birçok hastalığa ve hastalık salgınlarına neden olmaktadır.
Hücre içi bakteriler, şartlı bakterilerin aksine, belirli durumlarda enfeksiyonlara ve hastalıklara neden olabilen insan vücuduna girdiklerinde her zaman hastalığa neden olan patojenik bakterilerdir. Pek çok patojenik bakteri, kendilerini çoğaltmak ve hastalığı yaymak için açık bir yara gibi oluş avantajından yararlanarak koşulludur. Fırsatçı bakteriler normalde hastalığa neden olmayan, ancak hastanın güvenli bir bağışıklık sistemine sahip olması durumunda ortaya çıkacak olan bakteridir.
Birçok insan aslında herhangi bir zamanda çok sayıda bakteri barındırır. Bu bakteriler ortak veya “iyi” bakteriler olarak bilinir, çünkü insan vücudunda bazı hayati ve faydalı işlevler yaparlar. Bağırsaktaki ortak bakteriler, örneğin, yiyeceklerin parçalanmasına ve sindirilmesine yardımcı olur.
Patojenik bakteriler bir insan popülasyonu boyunca çeşitli şekillerde yayılabilir. Hava, su ve toprak tüm ortak vektörlerdir ve insanlar bakterileri doğrudan fiziksel temas yoluyla birbirine geçirebilirler. Bazı bakteriler, kapı kolları ve tıbbi ekipman gibi kolonileşme yerlerinde çok ustalaşırlar, diğerlerinden çok daha az virülanken insandan insana kolaylıkla hareket etmelerine izin verirler ve çok uzun süre insan ev sahiplerinden uzaktaysa ölürler.
Tüberküloz, onu ilgilendiren patojen bir bakteri yapan, dünyanın önde gelen katillerinden biridir. Patojen bakteriler ayrıca kronik ishal gibi bağırsak sorunlarından da sorumludur ve vücudun birçok yerinde enfeksiyonlara neden olabilirler. Bazıları ölümcül, Legionella bakteri gibi, bazıları ise özellikle tedaviye erişilebiliyorsa, nispeten iyi huyludur. Gelişmekte olan dünyanın en büyük sorunlarından biri, ilaçlara erişimin ve tıbbi tedavinin yetersizliği nedeniyle popülasyonlar tarafından kontrol edilmeyen tedavi edilebilir bakteriyel enfeksiyonların çoğalmasıdır.
Bir enfeksiyonun patojenik bir bakteri ile tedavisi, bakterileri öldürmek için özel olarak formüle edilmiş olan antibiyotiklerin kullanılmasını içerir. Bazı bakteriler antibiyotik direnci geliştirmiş, bu da birçok yaygın antibiyotiğe cevap vermeyebilecekleri anlamına gelmektedir. Bu ilaç şirketlerini bakteri mutasyonlarının önünde kalabilmeleri için yeni antibiyotikler araştırmaya zorlar.
