Bakteriyel teşhis, spesifik bakterilerin kimliğini tam olarak belirlemek için kullanılan bir işlemdir. Medikal tedavinin önemli bir parçasıdır, çünkü pek çok tedavi büyük ölçüde tıbbi bir soruna neden olan organizmanın kimliğine bağlıdır ve aynı zamanda bilimsel araştırmanın önemli bir parçasıdır. Bakterilerin tanımlanmasında bazı teknikler kullanılır ve insanlar bakteri hakkında daha fazla şey öğrendikçe ve yeni tıbbi ekipman geliştirildikçe sürekli olarak yeni teknikler geliştirilir.
Bakteriyel tanımlamanın ilk aşaması, söz konusu bakterilerin çalışan bir örneği olan bir izolat oluşturulmasını içerir. İzolatlar, bir hastadan veya bir nesneden alınan şüpheli bakterilerin küçük bir beziyle başlar. İzolat, bakterileri destekleyecek bir büyüme ortamı bulmak ve çalışma için yeterli miktarda bakteri kültürü oluşturmak suretiyle oluşturulur. Bakteriler çok seçici olduklarından ve sadece herhangi bir ortamda büyümeyeceklerinden, bu gerçek bir zorluk olabilir. Büyüme ortamını veya numuneyi kirletmekten kaçınmak önemlidir, çünkü bu kafa karıştırıcı sonuçlara neden olabilir.
Bir bakteri kültürlendikten sonra, kimliğine dair ipuçları sağlamak için çok çeşitli araçlar kullanılabilir. En temellerinden bir tanesi, bir kimyasal leke kullanımıyla bakterileri Gram pozitif ve Gram negatif bakterilere ayıran bir Gram boyasıdır. Kontrastı arttırmak için diğer lekeler kullanılabilir ve bu sayede bakterilerin mikroskopta görülmesini kolaylaştırır. Mikroskop altında görsel tanımlama yaygın olarak bilinen bakteriyel türlerle, özellikle de ayırt edici şekli olanlarda yapılabilir.
Bakteriyel tanımlama cephaneliğinde daha fazla araç var. Bir araştırmacı, bir bakteri genetik kodunun çözüldüğü bir reaksiyon veya gen sekansı olup olmadığını görmek için bilinmeyen bakteri numunesinin çeşitli antikorlara maruz bırakılmasını içeren serolojik metotlar kullanabilir. Gen dizilimi, birbirine yakın iki bakteri suşu arasındaki farkı ayırt etmek için de kullanılabilir, bir suşun neden bir diğerinin veremediği belli bir ilaç tedavisine cevap verdiğine dair bilgi verir. Ultraviyole radyasyon gibi çeşitli kimyasallara ve uyaranlara verilen yanıtlar da incelenebilir.
Bakterilerin tanımlanması laboratuarda klasik olarak yapılır, çünkü laboratuvarlarda bir bakteri kimliğinin izlenmesi sırasında kullanılabilecek tıbbi cihazlar, kimyasallar ve aletler vardır. Bazı laboratuvarlar, hastanelerden ve tıbbi kliniklerden örneklerin kültürlenmesi ve tanımlanmasında uzmanlaşırken, diğerleri, sınıflandırılabilmeleri için yeni ve bilinmeyen bakteri örneklerini belirleyerek araştırmaya odaklanır. Laboratuar ortamı, laboratuar çalışanlarının kontaminasyonunu ve yanlışlıkla bulaşmasını önlemek için sıkı bir şekilde kontrol edilmektedir, özellikle de virülan organizmalar, bilim adamları için birkaç koruma katmanı içeren yüksek güvenlikli laboratuarlarda çalışılmaktadır.
