Çok küçük miktarlarda bulunurken, her zaman çok sayıda endokrin sistem hormonu kanda taşınır. Steroidler ve tiroid hormonları plazma proteinleri tarafından dolaştırılırken, suda çözünür peptid hormonları kana difüzyonla taşınır. Nöronlar, nihayetinde dolaşım sistemine yerleştirilen, çevredeki interstisyel sıvıya salınması için nörohormonlar üretir. Hedef hücreler ve organlar tarafından sürekli olarak alındığında, hormon molekülleri, böbrekler tarafından idrar şeklinde salgılanacak karaciğer tarafından çıkarılabilir ve devre dışı bırakılabilir.
Steroid hormonları, kortizol ve erkek hormonları testosteron ve androstenedion gibi steroid hormonlarının serbest bırakılmasından sorumlu olan böbreklerin üzerine yerleştirilen adrenal bezlerin yüzeysel tabakası olan testisler, yumurtalıklar ve adrenal korteks tarafından salgılanır. Dişi endokrin sistem hormonları, yumurtalıklar tarafından salgılanan östrojen ve progesteron, dişi cinsiyet hücreleri olan yumurtaların üretimi ve salınması için gerekli üreme organlarıdır. Erkeklerde testisler, sperm üretiminin yanı sıra prostat dahil erkek cinsiyet özelliklerinin ve yapılarının geliştirilmesi ve korunmasında önemli bir steroid olan testosteron salgılarlar. Bazen erkek endokrin sistem hormonları, atletik rakipler tarafından sentetik anabolik steroidler biçiminde, kas, dayanıklılık ve dayanıklılığın artması amacıyla kötüye kullanılır.
Peptid kategorisine ait endokrin sistem hormonları, farklı boyutlarda suda çözünür moleküllerdir. Antidiüretik hormon (ADH) ve oksitosin gibi kısa nöropeptid zincirleri, nöroendokrin hücrelerinde hipotalamus tarafından üretilir ve yedi tanesi her bir hormonda aynı olan dokuz amino asitten oluşur. Aynı amino asitlerin çoğunu paylaşsalar bile, oksitosin ve ADH farklı şekilde çalışır. Adrenokortikotropik hormon (ACTH), kalsitronik ve glukagon gibi daha uzun peptid hormonları, her biri yaklaşık 30 amino asidi kapsar. Proteinler ayrıca yaygın olarak peptit grubuna yerleştirilir ve pankreas tarafından karbonhidratları ve lipitleri metabolize etmek için pankreas tarafından üretilen insülini, her ikisi de hipofiz bezi tarafından salgılanan tiroid uyarıcı hormonu (TSH) ve büyüme hormonunu içerir.
Amino asitlerin türevleri, tiroid hormonları gibi monoamin hormonları amino asit tirozin ve iyodürden yapılır. Aynı zamanda adrenalin olarak da adlandırılan epinefrin, adrenal bezlerin medullaları tarafından üretilir ve aynı zamanda modifiye tirozinlerden oluşur. Vücudun uyku-uyanıklık döngüsünü korumak için önemli olan melatonin, pineal bezdeki amino asit triptofandan sentezlenir. Diğer monoaminler arasında nörotransmiterler norepinefrin, dopamin ve serotonin bulunur.
