Antijen-antikor bağlanması, bir antikor çekildiğinde ve bir antijene bağlandığında meydana gelir. Bağlandığı halde, antikor sonunda antijenin yok edilmesine yol açacak kimyasal bir reaksiyon oluşturur. Sadece spesifik antikorlar, farklı antijen türlerine bağlanabilir, ancak yapıdaki benzer antijenler aynı antikorlar tarafından saldırıya uğrayabilir. Bir antijen ve bir antikor arasındaki bağ geri dönüşümlüdür, bu nedenle antikor, antijeni ortadan kaldırana kadar bağlı kalmak için bir antijene birden çok bağlantı kurmaya çalışmalıdır.
Pek çok farklı türde antijen vardır, ancak çoğu antikor çekebilecek protein antijenleridir. Virüsler ve bakteriler gibi birçok antijen zararlıdır, polenler veya diğer alerjenler gibi diğerleri zararsızdır. Antijen-antikor bağlanmasında yer alan antikorlar, immünoglobülinler olarak bilinir. Bunlar bir organizmanın bağışıklık sistemi tarafından yabancı cisimleri yok etmek için üretilen moleküllerdir.
İmmünoglobulinler, bazı antijenler için yüksek veya düşük bir afiniteye sahip olabilir. Afinite seviyesi yüksek olduğunda, antijen-antikor bağlanması güçlüdür. İmmünoglobülin ve antijen arasındaki bu güçlü bağlantı, immünoglobülinin, sonunda antijeni parçalayan ve yok eden bir kimyasal reaksiyonlar dizisini başlatmasını sağlar.
Bir antikorun bir antijen için afinitesi aşırı derecede yüksek olsa bile, antijen-antikor bağlanması kalıcı değildir. Antijenin antikorla olan bağlantısını saldırıya karşı bir savunma olarak koparması mümkündür. Buna karşı koymak için, antikorun, bir dizi farklı bağlantı yoluyla antijene bağlanmaya çalışması gerekir.
Antijen-antikor bağlanması, genellikle antijeni ve antikoru bir araya getirmek için zayıf elektrik yüklerinin kullanılmasına dayanır. Bağın bir tarafında elektron afinitesi ve diğerinde hafif bir negatif yük olması, bu iki molekül tipinin bağlanmasının en yaygın nedenidir. Molekülleri bir arada tutan bağ türleri, hidrofobik, elektrostatik veya hidrojen bağları veya Van der Waals kuvvetleri olabilir.
Tüm antijen-antikor bağlanması kovalent değildir; bu, elektron paylaşmadıkları anlamına gelir. Birbirlerine bağlıyken bile ayrık moleküller olarak kalırlar. Bu, ayrıldıklarında her birinin sağlam olduğu anlamına gelir.
