Amigdala beyinde genellikle duygusal durumlarla ilişkili bir yapıdır. Ancak, amigdala ve hafıza arasında güçlü bir bağlantı var. Hipokampus gibi limbik sistemin diğer parçaları ile birlikte hareket ederek, beynin bu kısmı duygusal hatıraları düzenlemeye ve kodlamaya yardımcı olur. Gelecekteki davranışlar genellikle duygusal hafıza tarafından belirlenir. Korku gibi bir duyguyu belirli bir olayla ilişkilendirmek, tehlikeli uyaranlara tepki vermesine ya da belirli bir yiyeceğe zevk hissetmek, gelecekteki diyet seçimlerini yönlendirmede yardımcı olabilir.
Amigdala'nın duygusal hafızanın oluşmasına nasıl yardım ettiği konusunda iki rakip teori vardır. Amigdala, hipokampus ile çalışarak duygusal belleği doğrudan bir dereceye kadar kodlayabilir. Alternatif olarak, hipokampus tarafından gerçekleştirilen hafıza işleme için girdi sağlayabilir. Bazı araştırmacılar bu teorilerin akıcı bir entegrasyonunu bile önerdiler, burada duygu ve hafızanın düzenlenmesi gerçekte bu yapıların ikisinde de aktivite kullanarak yapılabilir. Amigdala ve bellek, amigdala kendi başına hatıralar oluşturmasa da yakından ilişkilidir.
Bir korku tepkisini şartlandırmak, amigdala ve hafıza arasındaki önemli bir bağlantıdır, ancak bu yapı aslında hafızayı başka şekillerde etkiler. Amigdala, diğer beyin bölgelerinin uzun süreli hafızaları nasıl kodladığını düzenlemektedir. Bir olay sırasındaki daha büyük duygusal uyarılma beynin bu bölümünü aktive ettiğinde, olay daha güçlü bir şekilde kodlanmış ve daha kolay bir şekilde geri çağrılmış gibi görünmektedir. Amigdala ve hafıza arasındaki bu bağlantı, insanların neden travmatik olayları neden daha kolay hatırladığını ve duygusal içeriği olmayanlara nazaran açıklayabilir.
Amigdala ve hafızanın birlikte çalışabilmesi, hayatta kalmak için çok önemli olabilir. Ayrıca, çok güçlü bir bağlantıya sahip olmanın ve korkutucu veya travmatize eden olayları çok kolay hatırlamanın da bir eksiklik olabileceğini not etmek önemlidir. Travma sonrası stres bozukluğunun (TSSB) arkasındaki bir teori, stresli uyaranların veya ilk travmatik olaya benzer uyaranların, amigdalayı aşındırdığıdır. Buna karşılık, TSSB'si olan birey travmatize edici olayı ve başlangıçta ona eşlik eden olumsuz duyguları hatırlar. Aktivasyon üzerinde benzer bir durum, bazı endişe bozukluklarının bir özelliği de olabilir.
Olumlu duygular bile hatıraların saklanmasını kolaylaştırabilir. Herhangi bir türdeki duygusal uyarılma, amigdalada, nöronal bağlantılar oluşturma kabiliyetine bağlı olabilen senkronize aktiviteye yol açar. Bu güçlendirilmiş bağlantılar, hatıraların daha çabuk geri çağrılmasını sağlayan etkileşimi teşvik edebilir. Büyük amigdalaların bu başarıyı başarması için daha büyük bir yeteneği olabilir.
