Lenfatik sistem ve bağışıklık sistemi iki ayrı vücut sistemidir, ancak çeşitli şekillerde iç içedir. Bağışıklık sistemi tüm vücutta mevcuttur, ancak aktif bileşenlerinin çoğu lenfatik sistemin fiziksel yolu boyunca hareket eder. Lenf damarları olmadan, bağışıklık sisteminin çeşitli fonksiyonları neredeyse işe yaramaz hale gelirdi. Vücudun savunmasının çoğu beyaz kan hücrelerine dayanıyor ve lenfatik sistemden süzülen ek oksijen salınımı. Bu hücreler, bağışıklık sistemi tarafından yabancı ve tehlikeli olmaları düşünülen parçacıklarla savaşmak için ihtiyaç duyulan alana taşınır.
Lenfatik sistem ve bağışıklık sistemi arasındaki bağlantı ilk önce lenf sisteminin ikincil organlarından biri olan lenf düğümü içinde görülebilir. Bir influenza virüsünde kodlanmış veya kabuklu deniz hayvanlarında bulunanlar gibi herhangi bir protein vücut tarafından bir antijen olarak görülebilir. Hayvan alerjileri genellikle kedilere alerjik reaksiyon gösterdiği gibi istenmeyen bir proteinin varlığına da izlenebilir, çünkü kedi tehlikesi yüksek miktarda spesifik protein içerir. Lenf düğümleri dolaşım sistemi yoluyla antijeni lenf yolları yoluyla elde eder ve daha sonra antijeni CD4 T-Hücreleri gibi naif bağışıklık sistemi hücrelerine "tanıtır" ve maddeye akıllı bir bağışıklık tepkisi oluşturma işlemini başlatır. Lenf düğümleri ayrıca kan ve lenfün kendisini temizlemeye yardımcı olan yüksek konsantrasyonda bağışıklık sistemi makrofajlarına veya istenmeyen maddeleri sindiren hücrelere sahiptir.
Hem lenfatik sistemde hem de bağışıklık sistemlerinde önemli olduğu bilinen lenfositler, spesifik immün aracılı görevler için vücut tarafından ayırt edilebilen bir tür beyaz kan hücresi türüdür. Lenfositler kemik iliğinde, özellikle de femur gibi vücudun uzun kemiklerinde büyürler. Lenfositlerin bir kısmı timüs bezine göç eder ve lenfositin haline geldiği kesin T hücresi tipine bağlı olarak patojenleri çeşitli yollarla tanımlayan, doğrudan saldıran veya tahrip eden T-hücrelerine ayrılır. Lenfositler, hala kemik iliğinde iken B hücrelerine ayrılabilir. Olgunlaşma üzerine, B-hücreleri lenfatik sisteme ve bağışıklık sistemine katkıda bulunur ve vücutta hali hazırda tanınan bulaşıcı parçacıklarla savaşmak için antikorlar üretip hızlandırır.
Toz, küf ve polen gibi şeylere alerjiler, lenfatik sistem ve bağışıklık sistemi tarafından da aracılık eder. Tahriş edici maddeye maruz kaldıktan sonra, alerjik kişiler, buna duyarlı antikorlar, T hücreleri ve B hücreleri üretir. Antikorlar, en belirgin alerjik semptomların suçlusu olan histamin üreten başka bir beyaz kan hücresi türü olan mast hücrelerine bağlanır.
