Sindirim sistemi ve kolon, kolonun sindirim sisteminin son kısmı olmasıyla ilgilidir. Kalın bağırsak olarak da adlandırılan, kolonun kendi yönü ile ayırt edilen dört bölümü vardır: yükselen kolon, enine kolon, azalan kolon ve sigmoid kolon. Hem sindirim sistemi hem de kolon, kısmen sindirilmiş yiyecekleri vücutta hareket ettirir. Kolon ayrıca, bu kitlenin dışkı olarak vücuttan uzaklaştırılmasından önce kalan sindirilmemiş kütleden tuz, su, potasyum ve bazı vitaminleri çekmeye çalışır.
Ağızdan rektuma uzanan sindirim sistemi, gıdaları makro besin bileşenlerine (karbonhidratlar, yağ ve protein) ve ayrıca mikro besin bileşenlerine (vitaminler, mineraller ve su) parçalayan organları kapsar. Aynı zamanda, söz konusu besin maddelerinin emilimine katkıda bulunan organları içerir, böylece yiyeceğin kullanılmayan herhangi bir kısmını vücuttan taşıyanlara enerjiye dönüştürülebilirler. Sindirim, ağzın gıdaların fiziksel olarak parçalanmasıyla başlar ve yiyecekler yemek borusu boyunca ve yiyeceklerin kimyasal parçalanmasının çoğunun gerçekleştiği mideye taşınırken devam eder. Bolus veya kısmen parçalanmış kütle daha sonra makro besin içeriğinin çoğunun emileceği ince bağırsağa ulaşır.
İnce bağırsağın ötesinde, sindirim sisteminin en büyük organı olan kolon vardır. Yaklaşık 6 fit (1.8 metre) uzunluğunda, ince bağırsaktan yukarı doğru yönlendiren yükselen kolondan oluşur; abdominopelvik boşluğu yatay olarak geçen enine kolon; aşağı doğru 90 derece alan inen kolon; ve S harfi gibi kıvrımlı olan sigmoid kolon, sigmoidin rektumu buluştuğu yerde sona erer.
Sindirim sistemi ve kolon hem gıdaları vücuttan taşır, ancak önceki organların aksine, kolon sadece mikro besinlerin çıkarılmasını sağlar: mineraller, vitaminler ve su. Bunlar arasında kas işlevi için önemli olan ve ayrıca elektrolitler olarak da adlandırılan sodyum, magnezyum ve potasyum bulunur. Ayrıca burada emilen yağda çözünen A, D, E ve K vitaminleridir. Vücudun ihtiyaç duyduğu besin maddelerinin çoğu zaten emildiği için bunlar büyük miktarlarda alınmaz.
Sindirim sisteminin önceki organları ve kolon arasındaki bir başka fonksiyonel fark, kolondaki fermente edici bakterilerin varlığıdır. Flora olarak bilinir, kalın bağırsakta kalıcı olarak kalırlar ve simbiyotik bir ilişkinin tadını çıkarırlar. Bitki örtüsü, sindirilmemiş malzemede, çoğu sindirim sistemi ve kolon tarafından parçalanamayan ve dolayısıyla dışkıda elimine edilemeyen az miktarda lif besler. Buna karşılık, kolonun duvarlarını kaplayan hücrelerin sağlığına katkıda bulunan bu elyaf bozulmasından yan ürünler salgılarlar.
