Beyinde, limbik sistem hafızayı ve duyguyu düzenlemeye yardımcı olan birkaç yapıdan oluşur. Septal çekirdek veya septal alan olarak bilinen bu sistemin bir bileşeni, korkunun engellenmesinde ve zevkli tepkilerin ifadesinde rol oynar. Bu yapı, diğer limbik sistem yapıları dahil olmak üzere beynin birçok yerine, çoğu duyu sisteminden gelen uyaranları yönlendiren talamustan girdi alır.
Beynin ortasına yakın, korpus kallozumun hemen altında, etkileşime girdiği yapıların çoğunun yanında bulunan septal çekirdekler bulunur. Bu, beynin yarım kürelerini birbirine bağlayan bir sinir demetidir. Evrimsel bir bakış açısına göre bu alan, hafızada yer alan limbik sistemdeki bir yapı olan hipokampüsün bir parçası gibi görünüyor. Sonuç olarak, bu iki bölge arasında güçlü bağlantılar vardır.
Sinir çıkıntıları, her ikisi de otomatik işlemlerde yer alan beyin sapı ve hipotalamus ile hipokampal bağlantılara aracılık eder. Septal bölgenin medial ve lateral bölümleri bu üç alanın etkileşimini düzenliyor gibi görünmektedir. İşlevsel olarak bu, bu çekirdeklerin, hipotalamus ve beyin sapı tarafından aracılık edilen uyarılmaya yanıt olarak hipokampal hafıza oluşumunu düzenlemesini ve geri kazanılmasını sağlar.
Beynin korku ifadesi ve amigdala adı verilen diğer duyguların ifadesinde rol alan bir bölümü de septal çekirdekler aracılığıyla düzenlenir. Hipokampus ile olan bağlantıları gibi, bu çekirdekler de hipotalamus ile etkileşimi düzenler. Uyarılma ve amigdalanın aktivasyonu cinsel davranışa ve fiziksel temasa neden olabilir. Septal alan tarafından gönderilen inhibitör sinyaller bu yanıtı modüle eder ve daha ayırt edici teması arttırır. Bazı araştırmacılar bu inhibisyonun daha yakın, daha uzun ömürlü duygusal bağlar oluşturmaya katkıda bulunduğuna inanmaktadır.
Septal çekirdeğin kısımları bir ödül merkezi olarak hizmet eder, bu da bazı uyaranlara hoş tepkiler verdiği anlamına gelir. Bu tepkiler, belirli davranışlar için bir ödül duygusu yaratmaya yardımcı olur. Hayvan çalışmaları, farelerin bu bölgeyi doğrudan stimüle etmesini sağlayan cihazlar implante edildiğinde, hoş hissi yaşamak için bunu tekrar tekrar yapacaklarını göstermiştir.
Bazı zihinsel bozukluklar septal çekirdeklerde değişiklikler içerebilir. Bipolar bozukluğu olan ve şizofreni hastalarının, sağlıklı deneklerle karşılaştırıldığında bu alanda daha düşük hücre yoğunluğuna sahip oldukları bulundu. Ayrıca, majör depresif bozukluğu olan bireylerde de, bozukluklarının yaşadıkları sürenin düşük hücre yoğunluklarına sahip olmayla bağlantılı olduğu bir korelasyon vardı. Bu etkileşimin septal alanın duygusal düzenlemedeki öneminden kaynaklanması muhtemeldir.
