Bakteriyel algılama, birçok endüstride gıda, havayı ve suyu kontaminasyondan korumak veya tıbbi bir ortamda enfeksiyon kaynağını tanımlamak için önemlidir. Kültür toplama gibi geleneksel bakteri saptama yöntemleri etkilidir, ancak sonuçların gösterilmesi saatler veya günler alabilir ve çoğu bakteri türünü kaçırabilir. Süreci kolaylaştırmak ve saptama oranlarını artırmak için daha yeni, daha hızlı bakteri saptama yöntemleri geliştirilmiştir. Bunlardan bazıları polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), yiyeceklerde bakteri tespit eden kızılötesi aygıtlar ve kan trombositlerinde bakteri bulaşmasını tespit eden hızlı taramalar içerir. Bu yöntemlerin birçoğu, bakterilerin varlığını gösteren oksijen seviyelerini veya minik elektriksel bozuklukları ölçerek bakterileri tespit eder.
Geleneksel bakteri saptama tekniği, bir örnek almak, bir bakteri kültürü yetiştirmek ve büyüyen bakteri saymaktır. Bu yöntem kanda trombosit ürünlerini barındıran tıbbi ortamlarda yaygın olarak kullanılır. Trombosit ürünlerinin oda sıcaklığında depolanması gerektiğinden, bakteriyel kontaminasyon açısından yüksek risk altındadırlar.
Geleneksel kültür teknikleri, bakterilerin varlığını gösteren oksijen seviyesindeki değişiklikleri tespit eder, ancak sonuçlar yedi gün sürebilir. Tüm floresan etiketli bakterileri üç dakika içinde tespit edip sayan katı faz sitometrisi gibi bakterileri tespit etmek için daha yeni, daha hızlı sistemler var.
Trombosit ürünlerindeki bakterileri tespit etmek için kullanılan yöntemler gibi, su veya havadaki bakteri tespiti tipik olarak, suyun bir agar yüzeyine yerleştirildiği ve bir kültürün çoğalmasına izin verilen trombosit sayısını gerektirir. Bakterilerin çoğalmasına izin vermek için yeterli zaman geçtikten sonra, bakteriyel koloniler sayılır. Sudaki bakterileri tanımlamanın bir başka yolu, bakterileri floresan spektroskopisi ile tanımlanabilen floresan raportör molekülleri ile enfekte etmek için bir virüs kullanmaktır.
Çok çeşitli uygulamalar için potansiyeli olan daha yeni bir bakteri saptama yöntemi, içinden geçen bir elektrik akımına sahip bakteri antikorlarıyla kaplanmış bir sensördür. Bu sensör bakterilerle temas ettiğinde, sensör bakteriyel varlığını gösteren frekanstaki değişiklikleri tespit eder. Bu teknoloji, et işleme tesislerinde Escherichia coli (E. coli) bakterilerinin saptanmasının yanı sıra içme suyunda mikrosistin-LR (MC-LR) toksininin saptanmasını geliştirmek için kullanılmıştır. Bu teknoloji bakterileri dakikalar içinde algılar, oysa eski kültür yöntemi saatlerce gün alır.
PCR, diğer bakteri saptama yöntemlerine göre birçok faydası olan bakteri tanımlama moleküler bir tekniktir. Bazı tahminler, insan vücudundaki tüm bakterilerin yüzde 99'undan fazlasının kültürlenemediğini, geleneksel tekniklerin birçok uygulama için yetersiz kaldığını belirtiyor. PCR, RNA ve DNA amplifikasyon teknikleri kullanarak düşük miktarda bakteri çok hızlı bir şekilde tespit edebilir.
