En yaygın biyokimya konuları genel olarak şu kategorilere ayrılır: canlı hücre biyokimyası, metabolizma, hayvan veya bitki organizmaları, moleküler biyokimya ve genetik. Bu alanların her birinde, biyokimyacılar canlı organizmalarda meydana gelen kimyasalların ve biyokimyasal işlemlerin çalışmasına odaklanmaktadır. Bireysel bir canlı hücrenin incelenmesi, genellikle herkesin en yaygın biyokimya konularından biridir.
Biyokimya araştırmalarının sıklıkla tek bir hücrenin kimyasına odaklanmasının kilit bir nedeni, hem hayvanlar hem de bitkiler olmak üzere çok çeşitli organizmalarda yaşayan hücrelere ortak olan birçok kimyasal işlem türünün olmasıdır. Hücre biyolojisi, sitoloji olarak da bilinir ve bir hücrenin biyokimyasını anlamak, diğer biyokimya konularının çok büyük bir bölümünü oluşturur. Örneğin, farklı hücre tipleri arasında var olan benzerlik ve farklılıkların anlaşılması, örneğin genetik, metabolizma ve çeşitli hayvan biyokimyası alanlarını inceleyen biyokimyacılar için çok önemlidir.
Bazı biyokimyacılar biyokimya konularını ilgili temel kimyaya göre sınıflandırmayı tercih ederler. Bu tür bir sınıflandırma, örneğin, yağların yapısının, proteinlerin yapısının ve karbonhidratların yapısının temel konuları ile başlayabilir. Biyokimyasal işlemlerde yer alan ana moleküllerin temel yapısı anlaşıldıktan sonra, daha ileri çalışma farklı moleküllerin tipik olarak canlı bir hücrede yerine getirdiği işlevleri açıklayabilir.
Fonksiyonel biyokimya konuları daha sonra yapısal biyokimya veya moleküler biyoloji konularından takip edilebilir. Bunlar bağlanma veya farklı moleküllerin birbirleriyle nasıl etkileşime girdiğini; taşıma, yani moleküllerin canlı hücrelere nasıl girip çıktığını söylemek; kinetik veya kimyasal dönüşümler; ve sinyal verme veya canlı hücrelerin birbirleriyle nasıl iletişim kurduğunu gösterir. Bu yolla çalışan bir biyokimyacının, temel biyokimyada, daha sonra bir biyokimya kariyerinde çeşitli farklı uzmanlıklara dallanmak için kullanılabilecek iyi bir temel oluşturması olasıdır.
Bir biyokimya laboratuarında çalışılan farklı konular çok geniş olabilir. Yaşamın temel yapı taşlarını anlayan ayrı yaşam hücreleri, çoğu biyokimya iş fırsatı olmasa da çoğu için temel oluşturur ve bir biyokimya kariyeri için kilit başlangıç noktası olarak kabul edilebilir. Biyokimya konuları ile ilgili olarak, biyokimya, moleküler biyoloji ve diğer biyolojik çalışma alanları arasında da önemli bir örtüşme vardır.
