Bir durdurma kodonu, bir amino asidi kodlamayan haberci RNA (mRNA) 'da bulunan ve böylece bir protein üretimini durduran bir nükleik asit üçlüsüdür. Temel olarak, durdurma kodonu, mRNA kodunu çalıştıran ribozomlara durma zamanının geldiğini söyler; kişi onu neredeyse bir kağıt yaprağındaki delikli bir çizgi olarak düşünebilir; “burada yırtılma”. Durma kodonu bulunmadığında RNA'dan yapılan proteinler sonsuz amino asit zincirlerinden oluşacaktır çünkü ribozomlar ne zaman duracaklarını bilmeyecektir. .
Durdurma kodonları da DNA'da bulunur, böylece DNA RNA'ya kopyalandığında da taşınırlar. DNA'da, üç durak kodonu TAA, TAG ve TGA'dır. Bu üçüzler, hiçbir şeyi kodlamayan, hata yapma riskini azaltan “saçma” kodonlardır. RNA'ya kopyalandığında, durdurma kodonları UAA, UAG ve UGA'dır.
Bir proteindeki bir amino asit zincirinin uzunluğu değişebilir, bu, durdurma kodonlarının, proteinler yapmak için yapılması gereken bilgileri içeren genetik kodun alanları olan DNA ve RNA kodlamalarında değişen aralıklarda bulunduğu anlamına gelir. Durdurma kodonları, DNA sekanslandığında tanımlanabilir ve genetik koddaki belirli proteinlere karşılık gelen spesifik yerleri ve böylece belirli genetik bilgileri tanımlamak için kullanılabilir.
Diğer DNA alanlarında olduğu gibi, bir mutasyonun bir durdurma kodonunda görünmesi mümkündür. Kodon yanlış şekilde kopyalanabilir veya kodondaki nükleik asitler çıkarılabilir ve ribozomlar mRNA'yı amino asit zincirleri oluşturmak için çevirdiğinde sorunlara neden olabilir. Tek bir hücrede bu, hücrenin ölmesine veya bozulmasına neden olan rastgele bir mutasyona neden olabilir. Ancak, bir germ hücresindeki durdurma kodonlarında hatalar meydana gelirse ve germ hücresi başka bir organizmadan biriyle birleşirse, ortaya çıkan organizmanın doğuştan bir mutasyonu olur ve bazı durumlarda mutasyon organizmanın yaşayamayacağı kadar şiddetli olabilir. .
Genetikçiler, durdurma kodonları konusundaki bilgilerini kullanarak, bir DNA veya RNA parçasındaki bilgiyi sıralayabilirler. Durdurma kodonlarını arayarak, belirli amino asit zincirlerini tanımlayabilir ve genetik materyalin hangi proteinleri kodladığını belirleyebilirler. Bu bilgi ne yaptığı ve yanlış gittiğinde ne olduğu hakkında daha fazla bilgi edinmek için kullanılabilir. Bir durdurma kodonu bulmak, DNA ve RNA okurken tanımlanmış bir mutasyon veya varyasyon hakkında daha fazla bilgi edinmek için yararlı olabilir.
