Antikorlar, bağışıklık sisteminin bir parçası olarak vücutta dolaşan moleküllerdir. Bu moleküller, antijen olarak bilinen spesifik yabancı maddelere bağlanmak için ayrı ayrı tasarlanmıştır. Bireysel antijenler, özel şekillere ve kimyasal yapıya sahiptir, bu nedenle antikorlar, antijene uyacak şekilde özel olarak şekillendirilmiş bağlama bölgelerine sahiptir. Bir antijen ile bir antikor üzerindeki bir bağlanma bölgesi arasındaki bağın kuvvetine antikor afinitesi denir. Genel olarak, bu afinite ne kadar güçlü olursa, antikor istilacıyı tanımakta ne kadar etkili olabilir?
Her biyolojik organizma veya bir organizmanın bir kısmı organik moleküllerden oluşur. Bu moleküllerin düzenlenmesi ve miktarı organizmaya özgüdür. Örneğin, bir bakteri hücresi, her biri belirli bir işi yapan, kendisine yapışmış çeşitli moleküllere sahip yapısal bir hücre zarına sahiptir. Bazıları onları hücreye getirmek için çevresel maddelere bağlanabilir, oysa diğer harici moleküller bir konakçı istilası sırasında bakteriyi bir konak hücreye tutturmaya yardımcı olabilir.
İnsan vücudu, vücudu koruyan ve işgalcileri kontrol eden bir hücre ve molekül sistemi geliştirmiştir. Antikorlar, hücreler değil, istilacılara veya istilacıların parçalarına rastlamayı bekleyen, etrafında yüzen moleküllerdir. Antikor popülasyonu, her biri, bir bakteri hücresinin dışındaki dış moleküller gibi, belirli bir molekül tipine uyacak şekilde özel olarak yapılandırılmış çok çeşitli moleküllerden oluşur. Vücut, kızamık virüsü gibi bir patojene maruz kaldıktan ve enfeksiyonu gidermeyi başardıktan sonra, virüs üzerinde mevcut olan antijenlerin bir hafızasına sahiptir ve özellikle patojen tarafından başka bir enfeksiyonla savaşmak için özel antikorlar üretmektedir.
Bu özel antikorlar, virüs partikül antijenlerine mükemmel şekilde uyan bağlanma bölgeleri için belirli bir şekle sahiptir. Bir antikordaki bir bağlanma bölgesi arasındaki istilacı üzerindeki bir antijene bağlanma gücü, söz konusu bağlanma sahasının antikor afinitesi olarak bilinir. Antikor üzerinde birden fazla bağlayıcı bölgeye bakıldığında, bölgeler ve istilacı arasındaki bağın gücü, avidite veya antikorun fonksiyonel afinitesi olarak bilinir.
En basitinde, antikorlar ve antijenler, kimyasal bağlarla birlikte tutulan atomların koleksiyonlarıdır. Bir antijeni bir antikora tutan bağların türü, kovalent olmayan bağlardır; bu, tek tek atomların ve moleküllerin, elektron parçacıklarının hiçbirini paylaşmadığı, ancak zayıf elektrik çekiciliği gibi kuvvetler boyunca bir arada tutulduğu anlamına gelir. Normal olarak, elektronların bir molekülden diğerine hareketini içermeyen bağlar nispeten zayıftır, ancak çok sayıda kovalent olmayan bağ topluluğu güçlü olabilir. Bu durum, antikor-antijen etkileşimlerinde ortaya çıkar ve antikor yakınlığının temelini oluşturur.
Antikor afinite gücü, istilacıların etkili bir şekilde tanımlanması ve müteakip enfeksiyon temizliği için önemlidir. Aşılar, antijenlerin spesifik olarak hedef patojenden türetildiği ve çok iyi tanınması için tasarlandıklarından antijenlerine karşı güçlü antikor afinitesi üretme eğilimindedir. Bununla birlikte, güçlü antikor afinitesinin avantajlarına rağmen, vücut daha önce tanınan istilacılara bir şekilde benzeyen yeni istilacıları tanımalarına izin verebileceğinden, zayıf antikor afinitelerinden faydalanabilir.
