Bakterilerin yapısı diğer organizmalardan daha basittir. Bakteriler, zara bağlı organellerden ve iyi tanımlanmış bir çekirdekten yoksun mikroorganizmalardır. Genellikle bakteri türüne bağlı olarak dört şekilden birini benimserler ve farklı işlevlere sahip çok sayıda ekleri vardır.
Bakteriler tek hücrelidir, yani sadece tek bir hücreden oluşurlar. Bakterilerin, yiyecekler dışında hayatta kalmak ve üremek için ihtiyaç duydukları her şey, bu tek hücre içinde bulunur. Dolayısıyla, bakteri yapısı, hücrenin işini verimli bir şekilde sürdürmesini sağlayacak şekilde gelişmiştir.
Bakteriler prokaryottur, yani çekirdekleri yoktur. Çekirdek, deoksiribonükleik asidi (DNA) ve daha fazla gelişmiş hücrelerde replikasyon için gerekli olan genetik materyalleri barındıran organeldir. Bir çekirdeğin olmamasına rağmen, bakteriler hala DNA'ya sahiptir, ancak sitoplazma içinde serbestçe yüzer.
Bir hücre duvarı, bakterilerin sitoplazmik bölgesini veya içini çevreler ve tüm organizma için destek yapısı görevi görür. Hücre duvarının altında yatan tabaka, amino asitlerden ve şekerlerden oluşan bir molekül olan peptidoglikandan oluşur. Bu, bakterilere özgü bir özelliktir ve hücre duvarını hem iç hem de dış basınçlara karşı esnek kılan şeydir.
Peptidoglikan bakteriye şeklini verir. Belirli bir hücrenin şekli genellikle bu türden farklıdır ve bilinmeyen türlerin tanımlanmasında önemli bir ayrıntıdır. Bakteriler için iki yaygın şekil, çubuk şeklindeki basil ve spiral şeklindeki spirillumdur. Diğer yaygın formlar kokkus veya küreseldir ve içinde tek tek hücrelerin uzadığı ancak ayrılmadığı filamentlidir.
Hücre duvarının kaplanması, seçici olarak moleküllerin hücre içine ve dışına moleküler bir şekilde izin veren bir zardır. Sitoplazma, hücre zarının içindeki alanı doldurur. Sitoplazmanın içinde kromozomlar, hücrenin DNA'sı bulunur. Sitoplazma ayrıca hücre tarafından kullanılan proteinleri oluşturan ribozomları da içerir.
Hücre duvarının dış tarafında, bakterilerin başka nesnelere hareket etme ve bağlanma gibi eylemleri gerçekleştirmelerine yardımcı olmak için çeşitli uzantılar vardır. Protein filamentleri olan Flagella, organizmanın dışına yerleştirilir ve bakterileri kendi ortamı içinde hareket ettirir. Bakteriler türlere bağlı olarak bir veya daha fazla flagella içerebilir.
Bakterilerin bir başka yüzey özelliği de fimbradır. Bu protein lifleri, bakteriler tarafından kendisini başka yapılara bağlamak için kullanılır. Bakterinin tüm yüzeyinde bulunurlar ve flagella'dan çok daha küçüktürler. Üçüncü bir bileşen, hücrenin dış kısmında da bulunan ve pilus adı verilen iplik benzeri bir protein uzantısıdır. Bakteriyel konjugasyon ve ekinde Pili yardım.
