Oral mikrobiyoloji, ağzını kolonize eden bakteri, mantar ve virüslerin incelenmesidir. Bu küçük insan florası, genellikle biyofilmler olarak bilinen jelatinimsi kütlelerde birbirine yakın bir şekilde toplanır. Spesifik bakteri türleri geleneksel olarak oral patolojiden, diş eti hastalığına ve diş çürümesine neden olan sorumlu tutulmasına rağmen, oral mikrobiyoloji karmaşıktır. Bir mikroorganizmanın eylemleri ve etkileri diğerinin etkilerini etkileyebilir ve tüm koloni ağız boşluğu içinde kendi küçük ekosistemini oluşturur. Bilim adamları sağlıklı ve sağlıksız ağızlarda bulunan farklı türdeki mikropların önemi hakkında daha fazla şey öğrenmeye devam ediyorlar.
Oral mikrobiyoloji çalışmaları daha da zorlaştırılmıştır, çünkü ağzını kolonize eden mikroorganizmaların çoğu laboratuar koşullarında büyümeyecektir. Son zamanlarda, bakterilerin tanımlanmasındaki gelişmeler, mikroorganizmaların DNA'larından toplanmasını ve tanımlanmasını sağlamıştır. Bu teknik, normalde vücutta bulunan tüm bakterileri haritalamayı amaçlayan insan mikrobiyomu projesinde kullanılmıştır. Ağızdaki farklı mikroorganizma sayısının 700'den fazla olduğu tespit edilmiştir.
Farklı mikroorganizmalar arasındaki etkileşimler, bazı mikropların başkalarının büyümesini engelleyen veya teşvik eden faktörler ürettiği anlamına gelebilir. Diş çürümesine neden olan asit ürettiği bilinen S. mutans olarak bilinen bakteri, bir alkali madde üreten farklı bir bakteri yakınında bulunması durumunda sağlığa daha az zarar verebilir. Ağzın erken kolonizatörleri olma eğiliminde olan bu bakterilerin diş ve diş etlerine yapışmasını sağlayan özel yetenekleri vardır, daha sonra gelenler kendilerini erken yerleşimcilere bağlamaya güvenirler.
Araştırmacılar oral mikrobiyoloji hakkında daha fazla şey öğrenmeye devam ettikçe, basitçe mikroorganizmaları içeren madde olan plakayı çıkarmak, diş eti ve diş hastalıklarına en iyi cevap olmayabilir. Tüm mikropların uzaklaştırılması daha sonra zararlı mikroorganizmalar tarafından kolonize edilebilecek bir boşluk bırakır. Bu, bazı mikropların potansiyel olarak zararlı etkileri nötralize edilmiş veya çevrelerindeki diğer kişiler tarafından inhibe edildiğinden, sağlık tehdidi oluşturmayan dengeli bir bakteri karışımının yerini alabilir.
Bazı oral mikrobiyoloji araştırmacıları, yararlı bakterilerin ağız içindeki mikropların dengesini değiştirmek için kullanılabileceğini öne sürdüler. Asit üreten mikropların büyümesini engelleyen ve zararsız bir şekilde değiştiren oral boşluğa canlı bakteriler sokulabilirse, bu durum diş çürümelerini azaltmaya yardımcı olabilir. Zararlı bakterileri yok etmenin bir başka yöntemi, anti-mikrobiyal maddelerle onlara saldırmayı içerir. Bunlar, yalnızca zararlı türlere bağlanan moleküllere bağlanır.
