Qu'est-ce que le séquençage d'ADN?
Le séquençage de l'ADN est une collection de méthodes scientifiques pour déterminer la séquence des bases nucléotidiques dans une molécule d'ADN.Tous les organismes vivants ont de l'ADN (acide désoxyribonucléique) dans chacune de leurs cellules.Chaque cellule d'un organisme contient le code génétique de l'ensemble de l'organisme.Le processus de séquençage de l'ADN transforme l'ADN d'un organisme donné en un format qui peut être utilisé par les chercheurs pour l'étude de base des processus biologiques, de la recherche médicale et de la criminalistique.
Il existe plusieurs méthodes qui peuvent être utilisées dans le séquençage d'ADN.Les premières méthodes ont été développées dans les années 1970 et sont très laborieuses et prennent du temps.La réaction de séquençage la plus populaire et la plus courante utilisée aujourd'hui est le séquençage des didésoxynucléotides, qui peut être fait à la main ou par des machines, selon la quantité de matériau à séquencer.
La quantité de matériel génétique dans un organisme varie considérablement et est mesurée par le nombre de bases nucléotidiques qu'elle contient.Par exemple, un virus ou des bactéries pourrait avoir aussi peu que cinq mille bases, tandis que le génome humain contient environ trois milliards de bases.La méthode de séquençage des didésoxynucléotides du séquençage de l'ADN peut séquencer de nombreux génomes en jours et de grands génomes au cours des années plutôt que des décennies.
Il y a quatre étapes dans le séquençage de l'ADN.L'ADN doit d'abord être retiré de la cellule.Ensuite, il subit une réaction de séquençage.Ensuite, l'ADN est séparé par la taille, et finalement analysé par un ordinateur qui met les résultats dans un format utilisable.
La première étape du séquençage de l'ADN consiste à sortir l'ADN de la cellule.Cela peut être fait mécaniquement ou chimiquement.L'ADN est disponible en deux brins, mais un seul brin peut être séquencé à la fois.
Une fois que l'ADN est brisé, il est mis sur des vecteurs, qui sont des cellules qui se répliquent indéfiniment, ainsi qu'une amorce, qui est un produit chimique qui permettra le processus.Cela crée des clones de l'ADN de l'organisme qui est séquencé.La réaction de séquençage utilise l'amorce pour démarrer le processus chimique de reproduction du deuxième brin d'ADN.Le séquençage est effectué dans un cycleur thermique afin que la réaction soit répétée plusieurs fois.La répétition de la réaction entraîne un plus grand rendement d'ADN séquencé.
Après séquençage, l'ADN est trié par taille par électrophorèse capillaire.L'ADN est tiré par un courant électrique à travers un gel dans le capillaire, qui est un tube en verre très mince.Les brins d'ADN émergent triés par longueur.À mesure qu'ils émergent du capillaire, ils traversent un laser qui active les colorants qui identifient les bases nucléotidiques.Ces informations sont introduites dans un ordinateur, qui affiche ensuite la séquence d'ADN à l'écran.