Τι είναι ένας δείκτης μοριακού βάρους;

Ένας δείκτης μοριακού βάρους είναι ένα μόριο που χρησιμοποιείται για την παροχή μιας εκτίμησης του μεγέθους των μορίων που υποβάλλονται σε ηλεκτροφόρηση πηκτής.Αυτή είναι μια τεχνική στην οποία το DNA, το RNA ή οι πρωτεΐνες διαχωρίζονται από το μέγεθος, χρησιμοποιώντας ένα ηλεκτρικό ρεύμα σε ένα πήκτωμα.Αυτός ο όρος δεν πρέπει να συγχέεται με τους μοριακούς δείκτες στη γενετική mdash.Οι περιοχές στις οποίες το DNA ενός οργανισμού διαφέρει από τον υπόλοιπο πληθυσμό και μπορεί να ταυτοποιηθεί με έναν ανιχνευτή DNA.

Οι δείκτες μοριακού βάρους πρωτεΐνης χρησιμοποιούνται συνήθως όταν οι πρωτεΐνες διαχωρίζονται με ηλεκτροφόρηση πηκτής.Ο δείκτης μοριακού βάρους είναι μια ομάδα πρωτεϊνών γνωστού μοριακού βάρους, οι οποίες γενικά παρέχονται από εταιρείες βιοτεχνολογίας σε ένα συγκεκριμένο εύρος μεγέθους.Κάποιος επιλέγει το εύρος μεγέθους που βασίζεται στα δείγματα που μελετώνονται.Οι δείκτες μοριακού βάρους φορτώνονται και διαχωρίζονται κατά τη διάρκεια της εκτέλεσης.Με τη μέτρηση της απόστασης που διανύθηκαν από τους δείκτες και την πρωτεΐνη ενδιαφέροντος, μπορεί κανείς να καθορίσει το μέγεθος της πειραματικής πρωτεΐνης. Οι διαφορετικοί τύποι δεικτών μπορούν να απεικονιστούν σε διαφορετικούς τρόπους.Μερικοί από τους μοριακούς δείκτες είναι μη επισημασμένοι και χρωματίζονται στο πήκτωμα με τις υπόλοιπες πρωτεΐνες.Δεν είναι ορατά μέχρι να χρωματιστεί ολόκληρη η γέλη.Άλλοι τύποι πρωτεϊνικών μοριακών δεικτών έρχονται προ-χρωματισμένοι με χρώματα και κάθε τύπος πρωτεΐνης είναι ένα διαφορετικό χρώμα.Ο διαχωρισμός είναι ορατός καθώς λειτουργεί το πήκτωμα.

Ένα πλεονέκτημα ενός προ-χρωματισμένου δείκτη μοριακού βάρους είναι για κηλίδες Western.Αυτή είναι μια τεχνική στην οποία οι πρωτεΐνες μεταφέρονται σε μεμβράνη και στη συνέχεια χρωματίζονται με αντισώματα για την ανίχνευση μιας συγκεκριμένης πρωτεΐνης.Έχοντας χρωματισμένους δείκτες βοηθά να προσδιοριστεί εάν η μεταφορά των πρωτεϊνών ολοκληρώνεται πριν προχωρήσει με την υπόλοιπη διαδικασία. Οι δείκτες μοριακού βάρους χρησιμοποιούνται συνήθως για την ανάλυση του DNA σε πηκτώματα.Συχνά, οι μοριακοί δείκτες DNA είναι κατασκευασμένοι από τον βακτηριακό ιό

lambda

.Τα ένζυμα περιορισμού κατασκευάζονται από βακτήρια για να αφομοιώσουν το DNA των εισβολών οργανισμών και το ένζυμο περιορισμού

hindiii

χρησιμοποιείται συχνά για να υποβαθμίσει το DNA Lambda.Παράγει μια σειρά διαφορετικών, αναπαραγώγιμων θραυσμάτων γνωστών ως DNA Ladder .Συγκρίνοντας την απόσταση που διαχειρίζεται τα πρότυπα σε λογαριθμική κλίμακα, μπορεί κανείς να καθορίσει το μέγεθος των θραυσμάτων DNA που αναλύονται. Αυτός ο δείκτης μοριακού βάρους DNA μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την ανάλυση του μεγέθους του DNA που παράγεται κατά την απομόνωση των γονιδίων καιΠειράματα γενετικής μηχανικής.Μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί κατά τη διάρκεια της αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (PCR), στις οποίες οι μικρές ποσότητες DNA ή RNA ενισχύονται για να παράγουν μεγάλες ποσότητες προϊόντος.Οι τεχνικές PCR συνδέονται συνήθως με τις δοκιμές πατρότητας και την εγκληματολογική επιστήμη, αλλά είναι επίσης πολύ συνηθισμένες στην ιατρική και βασική βιολογική έρευνα.Οι ειδικοί δείκτες μοριακού βάρους είναι διαθέσιμοι για μικρότερα προϊόντα που παράγονται από ορισμένους τύπους PCR ή μικρά μόρια RNA.