Τι είναι το RetrotRransposon;

Οι τρανσποζόνια είναι κομμάτια DNA που είναι κινητά ή μπορούν να μετακινηθούν σε διαφορετικά μέρη μέσα σε γενετικές πληροφορίες ενός κυττάρου.Με τη μετακίνηση σε μια νέα θέση εντός του γονιδιώματος ενός κυττάρου, οι τρανσποζόνια μπορούν να προκαλέσουν μεταλλάξεις, καθώς και να αλλάξουν την ποσότητα του DNA που βρίσκεται μέσα στο κύτταρο.Αναφέρονται επίσης ως γονίδια πηδώντας και ομαδοποιούνται σε δύο κατηγορίες που είναι τρανσποζόνια κατηγορίας ΙΙ και τρανσποζόνια κατηγορίας Ι ή ρετροτρανσποζόνια.Η διαφορά μεταξύ αυτών των δύο κατηγοριών έχει να κάνει με το πώς κινούνται.Ένα ρετροτρανσποζονοειδές έχει μια διαδικασία κίνησης δύο σταδίων.

Η μέθοδος κίνησης του τμήματος του DNA είναι ο τρόπος με τον οποίο τα τρανσποζόνια ταξινομούνται σε κάθε κατηγορία.Ένα transposon κατηγορίας II είναι ένα κομμάτι DNA που κινείται από το ένα μέρος στο άλλο.Η κίνηση ενός τρανσποζονίου κατηγορίας Ι ή ρετροτρανσποζών είναι πολύ πιο περίπλοκη και περιλαμβάνει δύο βήματα για την κίνηση του τμήματος του DNA. Το πρώτο βήμα για την κίνηση ενός ρετροτρανσποζονίου είναι να δημιουργηθεί ένα τμήμα του RNA μέσω της μεταγραφήςενός κομματιού DNA.Το RNA είναι τώρα ελεύθερο να κινηθεί σε όλο το γονιδίωμα, καθώς δεν συνδέεται με ένα σκέλος του DNA.Όταν το RNA φτάσει στη νέα θέση, ένα συγκεκριμένο ένζυμο, που ονομάζεται αντίστροφη μεταγραφάση, κάνει ένα νέο κλώνο DNA με βάση το τμήμα RNA.Αυτό το νέο κομμάτι του DNA στη συνέχεια συνδέεται με τη νέα θέση εντός του γονιδιώματος. Όταν ένα ρετροτρανσποζονοειδή μεταγράφεται πίσω σε ένα τμήμα DNA από το αντίγραφο RNA, συνήθως έχει μακροχρόνιες επαναλήψεις τερματικών (LTRS) στο τέλος της αλληλουχίας DNA.Τα LTRs αποτελούνται από επαναλαμβανόμενες ακολουθίες βάσεων που μπορεί να είναι εκατοντάδες ή ακόμα και χιλιάδες βάσεις.Συνήθως περιβάλλουν ένα λειτουργικό τμήμα του DNA, όπως ένα γονίδιο, και είναι απαραίτητα για την προσάρτηση του τμήματος DNA στον αρχικό κλώνο DNA.Τα LTRs είναι ένας τρόπος με τον οποίο οι επιστήμονες μπορούν να αναγνωρίσουν ότι ένα τμήμα του DNA περιέχει ένα ρετροτρανσποζωνο.Θεωρείται ότι περίπου το 42% του συνόλου του ανθρώπινου γονιδιώματος αποτελείται από ρετροτρανσποζόνια.

Λόγω του γεγονότος ότι τα νέα αντίγραφα του DNA γίνονται μέσω της αντίστροφης μεταγραφής του RNA, η προσθήκη ενός ρετροτρανσποζονίου είναι ένας τρόπος για να αυξηθεί η ποσότητα του DNAΒρίσκεται μέσα σε ένα μόνο κελί.Εάν ένα ρετροτρανσποζονοειδές εισάγεται μέσα σε ένα γονίδιο ή κοντά σε ένα γονίδιο, τότε μπορεί να προκαλέσει μετάλλαξη.Οι μεταλλάξεις είναι βασικά αλλαγές στην αλληλουχία DNA και μπορούν να έχουν θετική, αρνητική ή καθόλου αντίκτυπο στο γονιδίωμα, ανάλογα με τον τρόπο με τον οποίο μεταβάλλεται η αλληλουχία του DNA.