Mi a DNS szekvenálása?
A DNS -szekvenálás tudományos módszerek gyűjteménye a nukleotid -bázisok szekvenciájának meghatározására a DNS molekulájában.Minden élő organizmusnak DNS -je van (dezoxiribonukleinsav) mindegyik sejtben.A szervezet minden sejtje tartalmazza a teljes szervezet genetikai kódját.A DNS -szekvenálás folyamata egy adott szervezetből származó DNS -t olyan formátumká alakítja, amelyet a kutatók felhasználhatnak a biológiai folyamatok, az orvosi kutatások és a kriminalisztika alapvető vizsgálatához.
Számos módszer használható a DNS -szekvenáláshoz.Az első módszereket az 1970 -es években fejlesztették ki, és nagyon fárasztó és időigényes.A manapság alkalmazott legnépszerűbb és leggyakoribb szekvenálási reakció a dideoxinukleotid szekvenálás, amelyet kézzel vagy gépekkel lehet elvégezni, a szekvenálandó anyag mennyiségétől függően.
A szervezetben a genetikai anyag mennyisége jelentősen eltér, és azt a tartalmazott nukleotidbázisok számával mérik.Például egy vírusnak vagy baktériumnak csak ötezer bázis lehet, míg az emberi genom körülbelül három milliárd bázist tartalmaz.A DNS -szekvenálás dideoxinukleotid -szekvenálási módszere sok genomot szekvenciákban, és a nagy genomok évek óta, nem pedig évtizedek óta.
A DNS -szekvenálásban négy szakasz van.Először a DNS -t el kell távolítani a sejtből.Ezután szekvenálási reakción megy keresztül.Ezután a DNS -t méret szerint választja el, és végül egy olyan számítógépen elemzi, amely az eredményeket felhasználható formátumba helyezi.
A DNS -szekvenálás első lépése az, hogy a DNS -t kiszedjük a sejtből.Ez mechanikusan vagy kémiai szempontból is megtehető.A DNS két szálban érkezik, de egyszerre csak egy szál szekvenálhat.
Miután a DNS feloszlatta, vektorokra helyezik, amelyek olyan sejtek, amelyek határozatlan ideig önfojtogatnak, és egy alapozóval együtt, amely egy olyan vegyi anyag, amely elindítja a folyamatot.Ez létrehozza a szekvenált szervezet DNS -jének klónjait.A szekvenálási reakció az alapozót használja a második DNS -szál reprodukciójának kémiai folyamatának megkezdéséhez.A szekvenálást termikus ciklusban végezzük úgy, hogy a reakciót többször megismételjék.A reakció megismételése nagyobb szekvenált DNS -hozamot eredményez.
A szekvenálás után a DNS -t méret szerint válogatjuk kapilláris elektroforézissel.A DNS -t egy elektromos áram húzza át a kapilláris gélen keresztül, amely egy nagyon vékony üvegcső.A DNS szálak hossz szerint válnak ki.Amint a kapillárisból származnak, áthaladnak egy lézeren, amely aktiválja a nukleotid alapokat azonosító színezékeket.Ezt az információt egy számítógépbe adják, amely a képernyőn megjelenő DNS -szekvenciát jeleníti meg.