Apa itu sekuensing DNA?

Sequencing DNA adalah kumpulan metode ilmiah untuk menentukan urutan basa nukleotida dalam molekul DNA.Semua organisme hidup memiliki DNA (asam deoksiribonukleat) di masing -masing sel mereka.Setiap sel dalam suatu organisme berisi kode genetik untuk seluruh organisme.Proses pengurutan DNA mengubah DNA dari organisme yang diberikan menjadi format yang dapat digunakan oleh para peneliti untuk studi dasar proses biologis, penelitian medis, dan dalam forensik.

Ada beberapa metode yang dapat digunakan dalam sekuensing DNA.Metode pertama dikembangkan pada tahun 1970 -an, dan sangat melelahkan dan memakan waktu.Reaksi sekuensing paling populer dan umum yang digunakan saat ini adalah sekuensing dideoxynucleotide, yang dapat dilakukan dengan tangan atau dengan mesin, tergantung pada jumlah bahan yang akan diurutkan.

Jumlah bahan genetik dalam suatu organisme sangat bervariasi dan diukur dengan jumlah basis nukleotida yang dikandungnya.Misalnya, virus atau bakteri mungkin memiliki sedikitnya lima ribu pangkalan, sedangkan genom manusia mengandung sekitar tiga miliar pangkalan.Metode sekuensing dideoxynucleotide dari sekuensing DNA dapat mengurutkan banyak genom dalam beberapa hari, dan genom besar dalam beberapa tahun, bukan beberapa dekade.

Ada empat tahap dalam sekuensing DNA.Pertama DNA harus dihilangkan dari sel.Kemudian mengalami reaksi pengurutan.Selanjutnya, DNA dipisahkan oleh ukuran, dan akhirnya dianalisis oleh komputer yang menempatkan hasilnya ke dalam format yang dapat digunakan.

Langkah pertama dalam sekuensing DNA adalah mengeluarkan DNA dari sel.Ini dapat dilakukan secara mekanis atau kimia.DNA hadir dalam dua untaian, tetapi hanya satu untai yang dapat diurutkan sekaligus.

Setelah DNA dipecah, ia dimasukkan ke dalam vektor, yang merupakan sel yang akan mereplikasi diri tanpa batas waktu, bersama dengan primer, yang merupakan bahan kimia yang memulai prosesnya.Ini menciptakan klon DNA organisme yang sedang diurutkan.Reaksi sekuensing menggunakan primer untuk memulai proses kimia mereproduksi untai DNA kedua.Urutan dilakukan pada pengendara sepeda termal sehingga reaksi diulang berkali -kali.Mengulangi hasil reaksi dalam hasil yang lebih besar dari DNA berurutan.

Setelah pengurutan, DNA diurutkan berdasarkan ukuran berdasarkan elektroforesis kapiler.DNA ditarik oleh arus listrik melalui gel di kapiler, yang merupakan tabung kaca yang sangat tipis.Untaian DNA muncul diurutkan berdasarkan panjangnya.Ketika mereka muncul dari kapiler, mereka melewati laser yang mengaktifkan pewarna yang mengidentifikasi basis nukleotida.Informasi ini dimasukkan ke dalam komputer, yang kemudian menampilkan urutan DNA di layar.