Apa itu jari seng?

Jari seng adalah lipatan protein berbentuk jari yang dibentuk oleh asam amino spesifik dalam protein yang mengikat ion seng.Protein ini sering berikatan dengan DNA dan RNA karena bentuknya memungkinkan interaksi ketat dari domain dengan nukleotida DNA dan RNA.Sifat pengikatan nukleotida mereka memungkinkan mereka berfungsi dalam mengatur ekspresi gen dan dalam perakitan virus.

Ada beberapa jenis struktur jari seng, tetapi versi yang paling umum terdiri dari helix alfa dan lembar beta, dua struktur sekunder yang paling umum dalam protein, di kedua sisi setidaknya satu ion seng.Lembar alpha helix dan beta dipegang pada posisi oleh residu sistin dan histidin, mengoordinasikan ion seng melalui atom nitrogen dan sulfur mereka.Jari seng berikatan dengan DNA, dan melalui interaksi asam amino di pinggirannya dengan pasangan basa di tengah heliks ganda DNA.Ini adalah domain protein yang ringkas, dan ukurannya yang kecil memungkinkannya untuk memiliki kedekatan dengan pasangan basa DNA.

Protein ini adalah faktor transkripsi yang paling umum dalam organisme hidup.Faktor transkripsi adalah protein yang berikatan dengan DNA dan mengontrol transfer informasi genetik ke RNA.Fakta bahwa protein untuk menargetkan DNA ini telah menjadikannya kandidat untuk rekayasa ulang yang disengaja untuk menargetkan urutan DNA yang menarik.

Misalnya, nuclease jari seng (ZFN) adalah protein sintetis yang memiliki domain pengikat jari seng yang direkayasa menyatu dengan restriksi endonuklease, atau enzim pembelahan DNA.ZFN dapat digunakan untuk memotong DNA di lokasi tertentu, dan merupakan alat yang berguna untuk mempromosikan rekombinasi DNA spesifik lokasi.Jari-jari seng yang direkayasa juga dapat digunakan sebagai faktor transkripsi buatan.

Domain jari seng ditemukan pada beberapa protein virus, termasuk protein neocapsid (NC) dari virus immunodeficiency-1 (HIV-1) manusia.NC adalah target antivirus yang menarik karena penting untuk perakitan virus dan sangat dilestarikan.Inhibitor yang secara khusus menargetkan jari -jari seng dari protein virus dan retroviral dapat digunakan untuk mencegah replikasi virus.Memperoleh senyawa antivirus seperti ini adalah area aktif penelitian biomedis.

Protein ini memainkan peran penting dalam metabolisme normal sel.Agar efektif, senyawa anti-retroviral harus secara khusus menargetkan protein jari seng retroviral.Protein retroviral ini memiliki urutan asam amino yang berbeda dan perbedaan struktural dari protein jari seng seluler, sehingga mendapatkan inhibitor selektif adalah tujuan yang dapat dicapai.