Ngón tay kẽm là gì?

Một ngón tay kẽm là một nếp gấp protein hình ngón tay được hình thành bởi các axit amin cụ thể trong protein liên kết với ion kẽm.Các protein này thường liên kết với DNA và RNA vì hình dạng của chúng cho phép tương tác gần của miền với các nucleotide của DNA và RNA.Các đặc tính liên kết nucleotide của chúng cho phép chúng hoạt động trong việc điều chỉnh biểu hiện gen và trong việc lắp ráp virus.Có một số loại cấu trúc ngón tay kẽm, nhưng phiên bản phổ biến nhất bao gồm một chuỗi xoắn alpha và tấm beta, hai cấu trúc thứ cấp phổ biến nhất trong protein, ở hai bên của ít nhất một ion kẽm.Bảng xoắn alpha và bảng beta được giữ ở vị trí bởi dư lượng cystine và histidine, phối hợp ion kẽm thông qua các nguyên tử nitơ và lưu huỳnh của chúng.Ngón tay kẽm liên kết với DNA và thông qua sự tương tác của các axit amin ở ngoại vi với các cặp cơ sở ở trung tâm của chuỗi xoắn kép DNA.Nó là một miền protein nhỏ gọn và kích thước nhỏ của nó cho phép nó có sự gần gũi với các cặp cơ sở DNA.Những protein này là yếu tố phiên mã phổ biến nhất trong các sinh vật sống.Một yếu tố phiên mã là một protein liên kết với DNA và kiểm soát việc chuyển thông tin di truyền sang RNA.Thực tế là các protein này để nhắm mục tiêu DNA đã khiến chúng trở thành ứng cử viên cho việc tái cấu trúc có chủ đích để nhắm mục tiêu các chuỗi DNA quan tâm.Ví dụ, một nuclease ngón tay kẽm (ZFN) là một protein tổng hợp có miền liên kết ngón tay kẽm được thiết kế hợp nhất với một endonuclease hạn chế, hoặc enzyme phân tách DNA.ZFN có thể được sử dụng để cắt DNA tại các vị trí cụ thể và là một công cụ hữu ích để thúc đẩy tái tổ hợp DNA cụ thể theo địa điểm.Các ngón tay kẽm được thiết kế cũng có thể được sử dụng làm yếu tố phiên mã nhân tạo. Các miền ngón tay kẽm được tìm thấy trong một số protein virus, bao gồm protein neocapsid (NC) của virus suy giảm miễn dịch ở người-1 (HIV-1).NC là một mục tiêu chống vi -rút hấp dẫn vì nó rất quan trọng đối với việc lắp ráp virus và được bảo tồn cao.Các chất ức chế đặc biệt nhắm vào các ngón tay kẽm của protein virus và retrovirus có thể được sử dụng để ngăn chặn sự nhân lên của virus.Có được các hợp chất kháng vi -rút có tính chất này là một lĩnh vực hoạt động của nghiên cứu y sinh. Các protein này đóng vai trò quan trọng trong quá trình chuyển hóa bình thường của các tế bào.Để có hiệu quả, các hợp chất chống retrovirus phải nhắm mục tiêu cụ thể các protein ngón tay kẽm retrovirus.Các protein retrovirus này có trình tự axit amin riêng biệt và sự khác biệt về cấu trúc so với protein ngón tay kẽm tế bào, do đó có được các chất ức chế chọn lọc là một mục tiêu có thể đạt được.