Mi a génexpressziós profilozás?

A gén expressziós profilozása egyidejűleg több ezer gén aktivitási szintjének mérésére szolgál.A génexpressziós minták azonosítása egy szervezetben a következő lépés a szervezet genomjának szekvenálás után.A génexpressziós profilozási kísérleteket általában egy szervezet teljes genomján végzik.A génexpressziós szintek mérése egy organizmusban képet ad arról, hogy a szervezet sejtjei hogyan működnek a sejtciklus alatt, vagy a specifikus ingerekre adott válaszként.Amikor egy gént bekapcsolnak, azt Messenger RNS -be írják, amely megadja az utasításokat a gén által kódolt fehérje elkészítéséhez.A gének bekapcsolásakor azt mondják, hogy expresszálódnak.Amikor egy gént kikapcsol, akkor azt nem írják át mRNS -be, és nem expresszálják.

Még egysejtű szervezet DNS-je több ezer gént tartalmaz, de ezeknek a géneknek csak egy töredéke van bekapcsolva bármikor.A gén expressziójának mintázatát egy sejtben egy adott időpontban génprofiljának nevezzük.A sejtben bekapcsolt gének típusainak áttekintése nagy mennyiségű jelentős információt szolgáltathat a sejtekről és az organizmusokról.

Egy gén expressziós profilozási kísérletben a DNS mikroarray technológiát alkalmazzák a korábban szekvenált gének relatív aktivitásának mérésére.Ezek a kísérletek általában magukban foglalják az mRNS mennyiségének mérését a kontroll beállításban és egy kísérleti környezetben, hogy meghatározzák egy vagy több változónak a gén expressziójára gyakorolt hatását.A kontroll használata fontos, mivel meghatározza a kiindulási mRNS -szinteket a normál sejtfeltételekhez.

Az, hogy megvizsgáljuk, hogyan változnak az mRNS -szintek az ingerekre adott válaszban, megmutatja, hogy a fehérjék celluláris szükségletei hogyan változnak az új környezeti állapotokra adott válaszként.Ez az információ tiszta kutatási célokra hasznos, de az orvostudományban is fontos lehet.Például, ha az emlőrákos sejteket használják a DNS mikroanalízisben, akkor egy profil azt mutathatja, hogy a rákos emlősejtekben egy bizonyos típusú receptor aktív, amely általában inaktív.Ha a receptor rák-specifikusnak bizonyul, akkor hatékony gyógyszercélnak bizonyulhat.Ez azért hasznos, mert a betegség azonos stádiumában a nők nagyon eltérően reagálhatnak a kezelésre, és nagyon eltérő prognózisokkal rendelkeznek.A DNS mikroanalízis felhasználása a génexpressziós profilok felépítéséhez legalább egy tanulmányban kimutatta, hogy az emlőrákos sejtekben egy bizonyos génexpressziós profil korrelál a rossz prognózissal.A génexpressziós profilozási technológia ezen alkalmazása segít azonosítani azokat a nőket, akik részesülhetnek az agresszívebb kezelésből.