Apa itu profil ekspresi gen?

Profil ekspresi gen adalah cara untuk mengukur tingkat aktivitas ribuan gen secara bersamaan.Mengidentifikasi pola ekspresi gen dalam suatu organisme adalah langkah berikutnya setelah genom suatu organisme diurutkan.Eksperimen profil ekspresi gen biasanya dilakukan pada seluruh genom suatu organisme sekaligus.Mengukur tingkat ekspresi gen dalam suatu organisme memberikan gambaran tentang bagaimana sel -sel organisme berfungsi selama siklus sel, atau sebagai respons terhadap rangsangan spesifik.

Gen organisme dapat berada di salah satu dari dua negara: dinyalakan atau dimatikan.Ketika suatu gen dinyalakan, itu ditranskripsi ke dalam messenger RNA, yang memberikan instruksi untuk membuat protein yang diberi kode oleh gen.Ketika gen dinyalakan, mereka dikatakan diekspresikan.Ketika suatu gen dimatikan, itu tidak ditranskripsi ke mRNA dan tidak diekspresikan.

DNA bahkan organisme bersel tunggal mengandung ribuan gen, tetapi hanya sebagian kecil dari gen yang diaktifkan kapan saja.Pola ekspresi gen dalam sel pada titik waktu tertentu disebut sebagai profil gennya.Melihat jenis gen yang diaktifkan dalam sel dapat memberikan sejumlah besar informasi signifikan tentang sel dan organisme.

Dalam percobaan profil ekspresi gen, teknologi microarray DNA digunakan untuk mendapatkan pengukuran aktivitas relatif dari gen yang sebelumnya diurutkan.Eksperimen ini biasanya melibatkan jumlah pengukuran mRNA dalam pengaturan kontrol dan dalam pengaturan eksperimental, untuk menentukan efek dari satu atau lebih variabel pada ekspresi gen.Menggunakan kontrol adalah penting karena menetapkan level mRNA awal untuk kondisi seluler normal.

Melihat bagaimana kadar mRNA berubah dalam menanggapi rangsangan menunjukkan bagaimana kebutuhan seluler untuk protein berubah dalam menanggapi kondisi lingkungan baru.Informasi ini berguna untuk tujuan penelitian murni, tetapi juga bisa menjadi penting dalam kedokteran.Misalnya, jika sel kanker payudara digunakan dalam analisis mikro DNA, profil mungkin menunjukkan bahwa dalam sel payudara kanker jenis reseptor tertentu aktif yang biasanya tidak aktif.Jika reseptor terbukti spesifik kanker, itu mungkin terbukti menjadi target obat yang efektif.

Profil ekspresi gen, pada kenyataannya, telah digunakan sebagai ukuran prognostik untuk kanker payudara.Ini berguna karena wanita pada tahap penyakit yang sama dapat merespons pengobatan yang sangat berbeda, dan memiliki prognosis yang sangat berbeda.Menggunakan analisis mikro DNA untuk membangun profil ekspresi gen telah menunjukkan setidaknya satu penelitian bahwa profil ekspresi gen tertentu dalam sel kanker payudara berkorelasi dengan prognosis yang buruk.Aplikasi teknologi profil ekspresi gen ini membantu mengidentifikasi wanita yang mungkin mendapat manfaat dari pengobatan yang lebih agresif.