Dalam genetika, apa metode senapannya?

Metode senapan digunakan untuk mengurutkan untaian panjang dari molekul asam deoksiribonukleat (DNA).Ini bergantung pada metode lain dari sekuensing DNA yang disebut metode terminasi rantai.Dengan metode senapan, para ilmuwan mengurutkan bagian untai DNA dan menggunakan hasilnya untuk membuat urutan kontinu.

Sequencing adalah proses menemukan komposisi atom suatu molekul dan menyelidiki ikatan kimia yang menyatukan atom -atom tersebut.Dalam DNA, sekuensing digunakan untuk menemukan urutan di mana molekul tertentu terjadi.Molekul -molekul ini disebut nukleotida.Empat basa nukleotida adalah adenin, guanin, sitosin, dan timin.

Salah satu cara untuk mengurutkan untaian panjang DNA adalah dengan menggunakan metode senapan.Dalam metode ini, DNA dipecah menjadi fragmen acak.Segmen yang dihasilkan kemudian diurutkan menggunakan metode yang disebut metode terminasi rantai.Pengakhiran rantai adalah metode pilihan untuk urutan DNA pendek.Ini menggunakan beberapa bahan kimia keras dan jumlah radioaktivitas yang lebih rendah daripada metode urutan pendek lainnya.

Dalam metode terminasi rantai, untaian DNA dibagi menjadi empat reaksi sekuensing.Masing -masing mengandung keempat nukleotida dan enzim yang bertindak sebagai katalis, yang disebut DNA polimerase.Dideoxynucleotide, yang pada dasarnya adalah bagian nukleotida yang hilang dari urutan gula, kemudian ditambahkan ke setiap reaksi sekuensing.Setelah memproses reaksi ini, para ilmuwan dapat membayangkannya dan membaca urutan DNA.

Selama metode senapan untuk mengurutkan DNA, semua ini terjadi beberapa kali menggunakan fragmen acak DNA yang berbeda.Ini menghasilkan beberapa bagian yang tumpang tindih dari DNA berurutan.Program komputer kemudian menggunakan bagian yang tumpang tindih untuk membuat urutan DNA kontinu.

Masalah dengan metode senapan adalah bahwa DNA sangat kompleks.Seringkali, ini mengandung urutan berulang yang terlihat sama tetapi datang membentuk bagian DNA yang berbeda.Set lengkap DNA manusia, yang disebut genom manusia, memiliki lebih dari tiga miliar pasangan basa.Satu -satunya cara untuk memastikan bahwa penempatan urutan berulang adalah benar adalah dengan melakukan lebih banyak bacaan acak sehingga setiap bagian diurutkan beberapa kali.Meski begitu, kesalahan terjadi.

Metode sekuensing senapan adalah ujung tombak sekuensing DNA hingga sekitar tahun 2005. Sejak itu, para ilmuwan telah menciptakan sekuensing generasi berikutnya, yang bekerja jauh lebih cepat.Keakuratan pembacaan individu kurang dari dengan sekuensing senapan, tetapi para ilmuwan dikompensasi untuk ini dengan mampu melakukan lebih banyak bacaan dalam waktu yang lebih singkat.