Sa genetika, ano ang paraan ng shotgun?

Ang pamamaraan ng shotgun ay ginagamit upang pagkakasunud -sunod ng mga mahahabang strands ng isang deoxyribonucleic acid (DNA) molekula.Ito ay nakasalalay sa isa pang paraan ng pagkakasunud -sunod ng DNA na tinatawag na paraan ng pagtatapos ng chain.Sa pamamaraan ng shotgun, ang mga siyentipiko na bahagi ng mga bahagi ng DNA strand at gamitin ang mga resulta upang lumikha ng isang tuluy -tuloy na pagkakasunud -sunod.

Ang pagkakasunud -sunod ay ang proseso ng paghahanap ng komposisyon ng atomic ng isang molekula at pagsisiyasat sa mga bono ng kemikal na nagkakaisa sa mga atomo.Sa DNA, ang pagkakasunud -sunod ay ginagamit upang mahanap ang pagkakasunud -sunod kung saan nangyayari ang ilang mga molekula.Ang mga molekulang ito ay tinatawag na nucleotides.Ang apat na mga base ng nucleotide ay adenine, guanine, cytosine, at thymine.

Ang isang paraan ng pagkakasunud -sunod ng mahabang strands ng DNA ay sa pamamagitan ng paggamit ng paraan ng shotgun.Sa pamamaraang ito, ang DNA ay nasira sa mga random na fragment.Ang nagresultang mga segment ay pagkatapos ay sunud -sunod gamit ang isang pamamaraan na tinatawag na paraan ng pagwawakas ng chain.Ang pagwawakas ng chain ay ang paraan ng pagpili para sa mga maikling pagkakasunud -sunod ng DNA.Gumagamit ito ng ilang mga malupit na kemikal at mas mababang halaga ng radioactivity kaysa sa iba pang mga maikling pamamaraan ng pagkakasunud -sunod.

Sa paraan ng pagwawakas ng chain, ang isang strand ng DNA ay nahahati sa apat na mga reaksyon ng pagkakasunud -sunod.Ang bawat isa ay naglalaman ng lahat ng apat na mga nucleotide at isang enzyme na kumikilos bilang isang katalista, na tinatawag na isang DNA polymerase.Ang isang dideoxynucleotide, na kung saan ay karaniwang isang nawawalang nawawalang bahagi ng pagkakasunud -sunod ng asukal nito, ay pagkatapos ay idinagdag sa bawat reaksyon ng pagkakasunud -sunod.Matapos maproseso ang mga reaksyon na ito, ang mga siyentipiko ay magagawang imahen sa kanila at basahin ang pagkakasunud -sunod ng DNA.

Sa panahon ng paraan ng shotgun ng pagkakasunud -sunod ng DNA, ang lahat ng ito ay nangyayari nang maraming beses gamit ang iba't ibang mga random na fragment ng DNA.Nagreresulta ito sa maraming mga overlay na seksyon ng sunud -sunod na DNA.Ang isang programa sa computer pagkatapos ay gumagamit ng mga overlay na seksyon upang lumikha ng isang tuluy -tuloy na pagkakasunud -sunod ng DNA.

Ang problema sa pamamaraan ng shotgun ay ang DNA ay hindi kapani -paniwalang kumplikado.Kadalasan, naglalaman ito ng paulit -ulit na mga pagkakasunud -sunod na mukhang pareho ngunit bumubuo ng iba't ibang mga bahagi ng DNA.Ang kumpletong hanay ng DNA ng tao, na tinatawag na Human Genome, ay may higit sa tatlong bilyong pares ng base.Ang tanging paraan upang matiyak na ang paglalagay ng paulit -ulit na mga pagkakasunud -sunod ay tama ay ang paggawa ng mas maraming random na pagbabasa upang ang bawat bahagi ay sunud -sunod nang maraming beses.Kahit na, naganap ang mga pagkakamali.

Ang paraan ng shotgun ng pagkakasunud-sunod ay ang pagputol ng gilid ng pagkakasunud-sunod ng DNA hanggang sa mga 2005. Simula noon, ang mga siyentipiko ay lumikha ng susunod na henerasyon na pagkakasunud-sunod, na mas mabilis na gumagana.Ang katumpakan ng mga indibidwal na pagbabasa ay mas mababa kaysa sa pagkakasunud -sunod ng shotgun, ngunit ang mga siyentipiko ay nabayaran para sa ito sa pamamagitan ng paggawa ng mas maraming pagbabasa sa mas kaunting oras.