Ano ang pagsusuri ng microarray?

Ang pagsusuri ng microarray ng DNA ay ginagamit sa molekular na biology at diagnostic na gamot upang matukoy kung aling mga gene sa isang cell ang nakabukas sa isang tiyak na punto sa oras.Ang pamamaraan na ito ay kilala bilang isang multiplex assay, dahil masusukat nito ang libu -libong mga sample sa isang solong assay.Ang mga diskarte sa microanalysis ng DNA ay ginagamit upang bigyang kahulugan ang data mula sa mga assays na isinasagawa sa RNA pati na rin ang DNA, depende sa partikular na mga kinakailangan ng eksperimento.Mga pagkakasunud -sunod ng DNA upang kumatawan sa isang partikular na gene.Ang isang eksperimento sa pagsusuri ng microarray ay isinasagawa sa isang solidong ibabaw na gawa sa isang baso o silicone chip kung saan inilatag ang isang kemikal na matrix.Sa ibabaw ng matrix DNA o RNA probes ay may linya sa mga maayos na hilera.

Kapag ang chip ay na -set up sa mga kinakailangang probes, ang mga cell na pinag -aaralan ay inihanda.Upang ihanda ang mga cell, dapat silang masira bukas upang ang mga nucleic acid na naglalaman nito ay maaaring ihiwalay.Ang isang serye ng mga reagents ay idinagdag upang kunin at pag -isiping mabuti ang mga nucleic acid na nilalaman sa loob ng mga cell.Susunod, ang katas ng nucleic acid ay idinagdag sa chip, na kung saan ay naiwan ng maraming oras upang payagan ang oras para sa mga probes na makipag -ugnay at magbigkis sa mga cellular nucleic acid.Sa wakas, ang isang karagdagang serye ng mga reagents ay idinagdag sa chip upang makilala ang mga lokasyon kung saan ang mga cellular nucleic acid ay nakagapos sa mga probes.Ito ay madalas na isang kumplikadong pagsusuri, dahil ang isang solong chip ay maaaring maglaman ng libu -libong mga natatanging mga probes.Ang pagkakasunud -sunod ng mga probes sa chip ay naka -imbak sa isang database ng computer upang ang mga resulta ay madaling makuha.Gamit ang chip at database, ang isang siyentipiko ay maaaring bumuo ng isang listahan ng mga gene na nakasalalay sa mga probes at samakatuwid ay naroroon sa orihinal na cellular extract.

Ang pamamaraan ng pagsusuri ng microarray ay karaniwang ginagamit sa profiling expression ng gene.Sa ganitong uri ng eksperimento, ang microarray ay naka -set up upang suriin ang mga pattern ng expression ng gene sa mga cell.Ang mga probes para sa mga genes ng interes ay kasama sa microarray, at kapag kumpleto ang eksperimento, ang pagsusuri ng data ng microarray ay maaaring matukoy kung alin sa mga gene na pinag -aralan ang nakabukas sa isang partikular na oras.

Ang iba pang mga gamit para sa pamamaraang ito ay may kasamang paghahambing na genomic hybridization at SNP detection.Ang paghahambing na genomic hybridization ay isang pagsubok na sinusuri ang genomic na nilalaman sa mga cell ng mga kaugnay na organismo.Ang ganitong uri ng assay ay nagbibigay ng impormasyon sa mga relasyon sa genetic sa pagitan ng iba't ibang mga species.Ang mga SNP ay nag-iisang nucleotide polymorphism, mga lokasyon sa genome kung saan mayroong dalawang posibleng mga pagkakasunud-sunod ng base-pares.Ang mga SNP ay maaaring magbigay ng isang hanay ng mga kapaki -pakinabang na impormasyon ng genetic dahil sa ang katunayan na ang iba't ibang mga pagkakaiba -iba ng SNP ay umiiral sa iba't ibang populasyon ng etniko at heograpiya.