Phân tích microarray là gì?

Phân tích microarray DNA được sử dụng trong sinh học phân tử và y học chẩn đoán để xác định gen nào trong tế bào được bật tại một thời điểm nhất định.Kỹ thuật này được gọi là xét nghiệm ghép kênh, bởi vì nó có thể đo hàng ngàn mẫu trong một xét nghiệm duy nhất.Các kỹ thuật phân tích vi mô DNA được sử dụng để giải thích dữ liệu từ các xét nghiệm được thực hiện trên RNA cũng như DNA, tùy thuộc vào các yêu cầu cụ thể của thí nghiệm.Trình tự DNA để đại diện cho một gen cụ thể.Một thí nghiệm phân tích microarray được thực hiện trên một bề mặt rắn được làm từ chip thủy tinh hoặc silicon trên đó được đặt một ma trận hóa học.Trên bề mặt của các đầu dò DNA hoặc RNA ma trận được xếp theo hàng theo thứ tự.Một khi chip đã được thiết lập với các đầu dò cần thiết, các ô được nghiên cứu được chuẩn bị.Để chuẩn bị các tế bào, chúng phải bị phá vỡ để các axit nucleic mà chúng chứa có thể được phân lập.Một loạt các thuốc thử được thêm vào để chiết xuất và cô đặc các axit nucleic có trong các tế bào.Tiếp theo, chiết xuất axit nucleic được thêm vào chip, sau đó được để lại trong vài giờ để cho phép các đầu dò tương tác và liên kết với các axit nucleic tế bào.Cuối cùng, một loạt các thuốc thử được thêm vào chip để xác định các vị trí nơi các axit nucleic tế bào đã liên kết với các đầu dò.

Phân tích microarray sau đó được sử dụng để xác định các đầu dò nào có thể phát hiện axit nucleic tế bào.Đây thường là một phân tích phức tạp, vì một chip đơn có thể chứa hàng chục ngàn đầu dò duy nhất.Thứ tự của các đầu dò trên chip được lưu trữ trong cơ sở dữ liệu máy tính để có thể thu được kết quả dễ dàng.Sử dụng chip và cơ sở dữ liệu, một nhà khoa học có thể phát triển một danh sách các gen liên kết với các đầu dò và do đó có mặt trong chiết xuất tế bào ban đầu.Kỹ thuật phân tích microarray thường được sử dụng trong hồ sơ biểu hiện gen.Trong loại thí nghiệm này, microarray được thiết lập để kiểm tra các mẫu biểu hiện gen trong các tế bào.Các đầu dò cho các gen quan tâm được bao gồm trên microarray và khi thí nghiệm hoàn tất, phân tích dữ liệu microarray có thể xác định gen nào được nghiên cứu đã được bật vào một thời điểm cụ thể.Các ứng dụng khác cho kỹ thuật này bao gồm lai tạo gen so sánh và phát hiện SNP.Phương pháp lai tạo gen so sánh là một thử nghiệm kiểm tra nội dung bộ gen trong các tế bào của các sinh vật liên quan.Loại xét nghiệm này cung cấp thông tin về mối quan hệ di truyền giữa các loài khác nhau. Phát hiện SNP là một kỹ thuật có thể được sử dụng trong phân tích pháp y, phân tích liên kết di truyền và đánh giá rủi ro bệnh di truyền.SNP là đa hình đơn nucleotide, vị trí trên bộ gen mà có hai chuỗi cặp bazơ có thể.SNP có thể cung cấp một loạt các thông tin di truyền hữu ích do thực tế là các biến thể SNP khác nhau tồn tại trong các quần thể dân tộc và địa lý khác nhau.