Τι είναι ο εγγύς προαγωγός;

Ένας εγγύς προαγωγός είναι μια περιοχή σε δεοξυριβονουκλεϊκό οξύ (DNA) λίγο πριν την έναρξη ενός γονιδίου όπου οι πρωτεΐνες και άλλα μόρια δεσμεύονται κατά την παρασκευή για να διαβάσουν αυτό το γονίδιο.Η περιοχή προαγωγού είναι απαραίτητη για την ανάγνωση και μεταγραφή των περισσότερων γονιδίων σε πρωτεΐνη, τόσο σε απλά προκαρυωτικά κύτταρα όσο και σε πιο σύνθετους ευκαρυώτες.Μια ποικιλία πρωτεϊνών που ονομάζονται παράγοντες μεταγραφής δεσμεύονται στο DNA σε αυτήν την περιοχή και εκτελούν πολλά καθήκοντα που προετοιμάζονται για μεταγραφή γονιδίων.Το πιο σημαντικό από αυτές τις λειτουργίες είναι η οικοδόμηση ενός ικριώματος πρωτεϊνών που συγκρατεί το DNA ανοιχτό και μεταγράφει ταυτόχρονα το σωστό γονίδιο.Τα προκαρυωτικά κύτταρα, εκείνα χωρίς πυρήνα, συνήθως έχουν έναν τύπο προαγωγού, ενώ τα ευκαρυωτικά κύτταρα, εκείνα με πραγματικό πυρήνα, έχουν άλλο.Οι υποκινητές συνήθως βρίσκονται μερικά νουκλεοτίδια προς τα πάνω ή πριν, το γονίδιο που ελέγχουν.Σχεδόν κάθε υποκινητής περιέχει μια ειδική ακολουθία νουκλεοτιδίων που το αναγνωρίζουν ως τέτοιο.Γενικά, οι προκαρυωτικοί υποκινητές αναγνωρίζονται από μια ομάδα νουκλεοτιδίων που ονομάζονται αλληλουχία Shine-Dalgarno και οι ευκαρυωτικοί προαγωγοί αναγνωρίζονται από μια συγκεκριμένη γενετική αλληλουχία που ονομάζεται Tata Box.μπορεί να τα αναγνωρίσει και τα γονίδια που ελέγχουν, κάπως δύσκολα.Η απόσταση μεταξύ ενός προαγωγού και του γονιδίου του δεν σταθεροποιείται μέσα σε ένα είδος ή μέσα σε έναν μόνο οργανισμό, οπότε ο καθορισμός του πού κάθονται σε σχέση μεταξύ τους δεν είναι ασήμαντη.Οι συνθέσεις αλληλουχίας προαγωγών δεν είναι πάντα πανομοιότυπες.Μπορούν πολύ σε μήκος, σύνθεση ή και τα δύο.Επιπλέον, οι ακολουθίες δείκτη του Box Shine-Dalgarno ή του Tata Box έχουν κάποια μεταβλητότητα σε αυτά.Ο τρόπος με τον οποίο οι ποικίλοι παράγοντες μεταγραφής αναγνωρίζουν τους υποκινητές ενάντια σε αυτή την εγγενή μεταβλητότητα δεν είναι εύκολο να προσδιοριστεί και τα νέα παραδείγματα εμφανίζονται συχνά που θέτουν υπό αμφισβήτηση αυτές τις προηγούμενες ισχυρές λύσεις. Όταν ένα γονίδιο είναι πολύ κοντά σε ένα άλλο γονίδιο, υπάρχει η πιθανότητα ότι υπάρχει αυτό που υπάρχειΟ εγγύς προαγωγός του θα μπορούσε να επηρεαστεί από τη δράση του κοντινού γονιδίου.Μερικές φορές, αυτό γίνεται σκόπιμα στο γονιδίωμα, ίσως για να τονώσει ταυτόχρονα πολλαπλά γονίδια ή να ρυθμίζει ταυτόχρονα τη δράση τους.Σε άλλες εποχές, μια σύνδεση μεταξύ δύο γονιδίων μέσω της δραστηριότητας ενός προαγωγού γίνεται κατά λάθος.Για να αποφευχθεί αυτή η διασταυρούμενη συζήτηση μεταξύ των γονιδίων όπου δεν δικαιολογείται, ορισμένα γονιδιώματα έχουν περιοχές μονωτή μεταξύ τους.Αυτή η επιπλέον περιοχή δεν είναι πάντα απαραίτητη και ορισμένα γονιδιώματα εμποδίζουν τη διασταυρούμενη συζήτηση με την τοποθέτηση γονιδίων με άλλους τρόπους, όπως η αναγκάζοντας ένα γονίδιο να είναι ανενεργό ενώ ένα άλλο είναι ενεργό.