Apa itu anotasi genom?

Genome Annotation Tags Bagian genom dengan informasi tentang data genetik yang dikandungnya.Ini adalah bagian dari proses di proyek genom, di mana tujuannya bukan hanya untuk mengurutkan DNA organisme target, tetapi untuk memahami apa yang dilakukannya dan bagaimana fungsinya.Para peneliti dapat melakukan anotasi di laboratorium mereka dan dapat berbagi data dengan ilmuwan lain untuk mengumpulkan sumber daya dan informasi.Database online yang terbuka untuk umum tersedia, dan beberapa juga memungkinkan anggota masyarakat umum untuk mengirimkan anotasi mereka sendiri.

Langkah pertama dalam anotasi genom adalah sekuensing, di mana para peneliti menentukan urutan asam amino dalam DNA organisme.Urutan seluruh genom membutuhkan waktu lama, dan adalah umum bagi para ilmuwan untuk mulai anotasi sebelum genom telah diterjemahkan.Dengan bagian DNA berurutan di tangan, seorang peneliti dapat mulai beranotasi.Para ilmuwan dapat mencatat di mana gen tampaknya dimulai dan berhenti, memperhatikan string DNA yang berbeda yang berisi informasi tentang fungsi genom.

Komputer mampu melakukan beberapa anotasi genom sendiri.Mereka dapat mencari pola yang diketahui, seperti string asam amino yang muncul di awal dan akhir gen.Dalam anotasi otomatis, komputer dapat menambahkan catatan ke berbagai bagian dari string DNA untuk memberikan informasi tentang hal itu.Dimungkinkan juga untuk membandingkan segmen dari berbagai organisme untuk mencari varian yang mungkin memberikan informasi penting tentang spesies secara keseluruhan.

anotasi genom manual melibatkan peninjauan fisik DNA secara fisik.Banyak peneliti menggunakan komputer untuk menampilkan informasi dan menandai, memungkinkan mereka untuk memasukkannya ke dalam basis data saat mereka bekerja.Dalam beberapa kasus, tinjauan manual mungkin diperlukan setelah anotasi otomatis, untuk memastikan komputer mendapatkan informasi yang benar.Ini bisa menjadi proses yang melelahkan dan terjadi kesalahan, yang merupakan salah satu alasan peneliti suka mengumpulkan database.Jika anotasi tidak cocok dengan orang lain pada bagian DNA yang sama, orang dapat mengevaluasi informasi untuk menentukan apa yang terjadi, dan memperbaiki kesalahan.

Tidak selalu mungkin untuk menentukan apa yang dilakukan gen selama proses anotasi genom.Para ilmuwan dapat menandai gen dan memisahkannya dari komponen genom lain, seperti pengulangan DNA non-coding.Informasi ini dapat digunakan dalam penelitian karena orang mengembangkan teori tentang berbagai segmen genom.Mereka dapat menambah anotasi untuk mencatat fungsi gen.