Skip to main content

胆汁産のシーケンスとは何ですか?

bis亜硫酸シーケンスは、メチル化を使用してDNAの異なる領域を分析する方法です。メチル化は、メチル基と呼ばれる特定の分子をヌクレオチドに添加するプロセス、この場合は通常はシトシンです。不活性ヌクレオチドはしばしばメチル化されるため、この方法は、ゲノムの活性領域の決定から遺伝子が豊富な領域の特定まで、さまざまな目的に使用できます。ビーズル酸塩シーケンスでは、メチル化シトシンは配列決定プロセスの影響を受けませんが、非メチル化シトシンはウラシルに変換されます。これは、遺伝物質ではないデオキシリボ核酸(DNA)には通常は見られないヌクレオチドです。メチル化、結合の小さな変化は、研究者に特定のヌクレオチドに関する具体的な情報を与えることができます。ビーズル酸ナトリウムはシトシンをウラシルに変換しますが、変換はメチル化シトシンがこの変化を起こさない環境で起こります。ビスル酸塩シーケンスが完了すると、元のDNAは有意に異なる分子に変換されています。シトシンは大幅に枯渇するか、潜在的に存在しません。この変換された分子でシトシンがまだ見られる場合、検討中のゲノムの天然のメチル化シトシンを表します。その最も重要な欠点は、適切に動作するために非常に高い塩濃度が必要であることです。この塩は、一本鎖DNAのより天然の二重らせんにアニーリングを促進し、二本鎖DNAの一部である場合、亜硫酸ナトリウムは常にシトシンに到達することができません。塩濃度が高すぎる場合、多くのシトシンがウラシルに変換されない可能性があり、ゲノム内のメチル化シトシンの誤った同定をもたらします。偽陽性の識別の数を最小限に抑えるには、変性剤が必要になる場合があります。元の核酸源は関係ありませんが、ソースはDNAでなければなりません。理論的には、ほとんどのRNAは単一鎖であり、ブロックされたヌクレオチドのために偽陽性の影響を受けやすいため、リボ核酸(RNA)はこの方法を使用して配列決定できます。ただし、RNAにはウラシルが含まれているため、実践すると、RNAには亜硫酸塩シーケンスは有用ではありません。ある種の外部マーキングまたはプロトコルへの追加がなければ、変換されたシトシンは天然のウラシルと区別できません。亜硫酸水素酸シーケンスのような敏感な方法は、信頼できる配列分析手段を提供し、これにより、遺伝子分析と薬物および治療の標的の同定が可能になります。この方法は生きている人には使用することはできませんが、それは依然として最も小さな組織サンプルだけで作業することで大きな助けになる可能性があります。