コンティグとは何ですか？

Contigは、連続した略で、隣接するデオキシリボ核酸（DNA）セグメントまたは、連続的で広範囲にわたる、途切れないDNA配列を形成する重複セグメントの産物のいずれかを指します。これらのセグメントのマップを研究することにより、さまざまなシーケンスを含むセグメントの順序を発見することができ、コンティグを追加、削除、または再配置して新しいシーケンスを形成できます。DNA Contigマッピングとライブラリにより、研究者は病気を引き起こす可能性のあるアラインメントを特定し、特定の条件下で細胞がどのように反応するかをよりよく理解し、生物の好ましい特性をクローンする能力を可能にします。一致したシーケンスタグ付きセットの重複、または発現したシーケンスタグを一致させることにより。DNAセグメントのベースで使用されるこのビルディングブロックプロセスを理解することにより、コンティグは望ましいシーケンスに複製またはクローン化され、好ましくないセグメントを追加または排除することができます。研究者は、これらのシーケンスを、非常に詳細でコンピューター化されたDNAプログラムのマップと見なしています。このプログラムは、セグメントを構築するために使用される塩基の視覚的な内訳と、特定のシーケンスを構築するために使用されるセグメントを提供します。さまざまな配色を使用して、さまざまなContigプログラムがこの情報を低、中、高品質のシーケンスとして表示します。

contigマッピングは、遺伝的障害の原因に頻繁に光を当てます。たとえば、ウィリアムズ症候群は、心血管の問題、血液カルシウムレベルの上昇、繁栄の失敗など、小児に多系の症状を引き起こします。研究者は、特定の遺伝子に影響を与えるバンドの削除を発見しました。これは、コンティグの不適切な重複によって引き起こされる可能性があります。別の遺伝的小児障害であるCri-du-chat症候群も複数の症状を引き起こします。それぞれが科学者が削除や異常なポジショニングと相関すると考えています。

研究者はまた、植物種のコンティグシーケンスを分析します。各植物にはその植物に固有のシーケンスが含まれており、個々の植物種の地図を取得することにより、科学者は特定の植物タイプの健康または劣化に寄与する可能性のある類似のさまざまな特性を発見します。生物を運ぶ疾患のコンティグセグメントとシーケンスを分析することにより、医師は治療開発に使用できる特性を決定できます。マッピングは、シーケンスの削除またはクローニングを介した遺伝子操作の可能性に対する視覚的な洞察を提供します。scientists科学者は、細菌の人工染色体、酵母人工染色体、またはP1またはファージ人工染色体培地でクローン化されたDNAサンプルを栽培する可能性があります。これらの染色体には、コンティグセグメントをコンパイルする50〜数万の塩基が含まれています。コロニー形成の期間後、サンプルをシリンジを使用して抽出し、DNAシーケンスゲルに入れて、電気泳動と乾燥を受けます。オートラジオグラフはサンプルを読み取り、シーケンスを指紋します。その後、研究者はフィンガープリントを画像ファイルにスキャンし、後でコンティグプログラムにロードされる場合があります。