Mi a genom összeszerelése?

A genom összeszerelése arra utal, hogy sok apró genetikai szekvenciát szedünk, és összevonják őket egy koherens egészbe, amely a szervezet teljes genomját képviseli.Ez a bioinformatika területének fő hangsúlya, és erre a célra számos genomprojekt létezik.A genom összeszerelését számos faj, köztük az emberek, növények, állatok és baktériumok genomjainak elemzésére használják.Sok más elemzési módszer a sikeres összeszerelésre épül, és a gének azonosítása nem haladhat anélkül.Még azelőtt, hogy a géneknek a sikeres genom -összeállítás még sok hasznos információt generálhat a későbbi elemzéshez, beleértve a genom méretét, szerkezetét és általános összetételét.anélkül, hogy kép vagy hasznos formák lenne útmutatóként.Amikor szembesülnek az első genomdarabokkal, úgynevezett RAW leolvasások, ritkán vannak jelek, ahol egy adott darab megy, vagy akár orientált.Minden darabot hasonlóan kódolunk a négy DNS -bázissal, rövidítve A, C, G és T.Nem garantálja azt sem, hogy a nyers leolvasások egy része nem ugyanazon genom terület másolatai, ami azt jelentené, hogy kevésbé egyedi információ létezik, mint az első pillantásra.Noha a fajok közötti genomok jelentősen különböznek, vannak bizonyos szabályok, amelyeket a specifikus genomtípusok követnek, és ezeket alkalmazhatjuk, ha egy másik azonos típusú genomot összeraknak.Például, ha egy bizonyos típusú szervezetnek mindig van egy bizonyos mintája a közelben, ahol géneket találnak, akkor ésszerűen feltételezhető, hogy egy másik, mint egy másik szervezet összeállításakor egy ilyen minta megtalálása jelzi a közeli gént.Nagyobb léptékben sok bakteriális genomnak van egy kör alakú kromoszóma, tehát ésszerű lenne előre jelezni, hogy egy új baktérium minden nyers leolvasása valamilyen módon illeszkedik egy kromoszómán.Az általános genetikai ismeretek ilyen módon történő alkalmazása lehetővé teszi a kutató számára, hogy potenciálisan több százezer adatot érjen el.Nem számít a módszer, a genom összeszerelése nagy munka, amely gyakran időigényes és nehéz.Mivel ez a szervezet sok jövőbeli genetikai elemzésének alapja, kevés hely van a hibára.