Apa itu Majelis Genome?

Perakitan genom mengacu pada proses mengambil banyak bagian kecil dari urutan genetik dan menggabungkannya menjadi keseluruhan yang koheren yang mewakili suatu organisme seluruh genom.Ini adalah fokus utama bidang bioinformatika, dan berbagai proyek genom ada untuk tujuan ini.Perakitan genom telah digunakan untuk mulai menganalisis genom banyak spesies, termasuk manusia, tanaman, hewan, dan bakteri.

Menganalisis gen organisme adalah proses yang panjang, dan perakitan genom adalah salah satu langkah pertama.Banyak metode analisis lain dibangun di atas perakitan yang berhasil, dan identifikasi gen tidak dapat berkembang tanpanya.Bahkan sebelum gen ditemukan, perakitan genom yang berhasil masih dapat menghasilkan banyak informasi yang berguna untuk analisis selanjutnya, termasuk ukuran genom, strukturnya, dan komposisi umum.

Proses perakitan genom seperti menyatukan teka -teki jigsaw bersama -samatanpa memiliki gambar atau bentuk yang bermanfaat sebagai panduan.Ketika dihadapkan dengan potongan genom pertama, yang disebut RAW Reads, jarang ada indikasi di mana bagian tertentu pergi, atau bahkan bagaimana berorientasi.Setiap bagian diberi kode serupa dengan empat basis DNA, disingkat A, C, G, dan T. Genom dapat dipadatkan menjadi satu kromosom besar atau dibagi menjadi banyak.Juga tidak ada jaminan bahwa beberapa bacaan mentah bukan duplikat dari area genom yang sama, yang berarti bahwa informasi yang kurang unik ada daripada yang muncul pada pandangan pertama.

Pengetahuan umum tentang struktur genom sangat berharga ketika memulai proses perakitan.Meskipun genom antar spesies sangat berbeda, ada aturan tertentu yang diikuti oleh tipe genom spesifik, dan ini dapat diterapkan ketika menyatukan genom lain dari jenis yang sama.Misalnya, jika jenis organisme tertentu selalu memiliki pola tertentu di dekatnya di mana gen ditemukan, orang dapat berasumsi secara wajar, ketika mengumpulkan organisme lain yang mirip dengannya, bahwa menemukan pola seperti itu akan menandakan gen di dekatnya.Pada skala yang lebih besar, banyak genom bakteri memiliki satu kromosom melingkar, sehingga akan masuk akal untuk mengantisipasi bahwa semua bacaan mentah dari bakteri baru entah bagaimana cocok dengan satu kromosom.Menerapkan pengetahuan genetik umum dengan cara ini dapat memungkinkan peneliti untuk mulai memahami ratusan ribu data yang berpotensi.

Ada banyak metode lain yang dapat digunakan dalam perakitan genom, termasuk prediksi komputasi dan perbandingan manual.Tidak peduli metodenya, perakitan genom adalah pekerjaan besar yang seringkali memakan waktu dan sulit.Karena ini adalah dasar untuk banyak analisis genetik di masa depan pada suatu organisme, ada sedikit ruang untuk kesalahan.