Was ist eine Genomdatenbank?

Ein Genom ist eine Sammlung aller in einem Organismus vorhandenen genetischen Material.Da die Sequenz und Struktur dieses genetischen Materials das gesamte biologische Leben antreibt, sind Wissenschaftler sehr daran interessiert, herauszufinden, wofür sie alle sind.Eine Genomdatenbank ist eine quer-referenzierte Sammlung von Informationen über einen oder mehrere Organismen, sodass ein Wissenschaftler alle verfügbaren genetischen Informationen untersuchen kann, um ihm in der Forschung zu helfen.von Informationen.Computerisierte Datenbanken sind daher die einzige praktische Möglichkeit, die Details an einem Ort zu organisieren.Im Allgemeinen sind diese als Online -Datenbanken für die wissenschaftliche Forschung verfügbar.Ein relativ neues Wissenschaftsfeld namens

bioinformatik, ist so gut wie die interpretierenden biologischen Daten durch Computersysteme gekommen.

Datenbanken von Genomen enthalten die Sequenz der Gene eines Organismus, wenn die gesamte Sequenz bekannt ist.Andernfalls kann es Teilsequenzen enthalten.Die menschlichen, Maus- und

-Drosophila -Fliegengenome wurden zum Beispiel sequenziert.Wenn die Sequenz eines Genoms bekannt ist, können Genetiker bestimmte Gene im Genom identifizieren.Jedes Gen ist das Anweisungsblatt für ein bestimmtes Zellprodukt. Wenn ein Gen eine Mutation hat, hat es eine andere Sequenz als das normale, funktionelle Gen.Mutationen können vorteilhaft sein und ein nützliches Merkmal im mutierten Organismus hervorrufen.Sie können auch keinen Unterschied für das Produkt machen oder sich nachteilig auf die normalen Arbeiten des Organismus auswirken.Viele Erkrankungen beispielsweise sind auf Mutationen in einem bestimmten Gen zurückzuführen.

Mutationen können auch verwendet werden, um zu berechnen, wie eng verwandt eine bestimmte Spezies mit einer anderen Spezies ist, da sich im Laufe der Zeit mehr Mutationen ansammeln.Individuen können auch in der Genomsequenz variieren, insbesondere wenn große Teile des Genoms keine Gene sind und für ein essentielles Zellprodukt nicht codieren.Eine Genomdatenbank enthält eine Sequenz von einem Organismus, der als Standard bezeichnet wird. Es wird jedoch viele geringfügige Unterschiede zwischen dem willkürlich ausgewählten Standard und den anderen Individuen einer Art geben.

Trotz des Vorhandenseins vieler Unterschiede sind Gene durch Sequenzen erkennbar.Wenn Genetiker wissen, was ein bestimmtes Gen in einem Organismus tut, führt ein Gen mit einer ähnlichen Sequenz in einem anderen Tier höchstwahrscheinlich dieselbe Funktion aus.Genetiker können eine Genomdatenbank verwenden, um entweder ein Gen zu identifizieren, das sie untersuchen, oder um herauszufinden, was das Gen tut.

Jede Genomdatenbank ist durchsuchbar.Normalerweise können Wissenschaftler eine Datenbank auf verschiedene Arten durchsuchen.In der Regel kann er oder sie die Sequenz eines Gens eingeben, das er oder sie sequenziert hat.Anschließend findet die Datenbank eine oder mehrere ähnliche Sequenzen zum Vergleich.

Eine einfachere Art der Suche in der Datenbank besteht darin, nach einem Gen -Schlüsselwort wie dem Namen des Gens zu suchen.Behörden wie die US National Authority for Biotechnology Information (NCBI) können Sequenzen unterschiedliche Referenznummern geben, und ein Genetiker kann auch eine Genomdatenbank unter Verwendung einer dieser Identifikatoren durchsuchen.Er oder sie kann die Ergebnisse auch mit mehr Suchparametern eingrenzen.Cross-Referenzinformationen sind eine Funktion der meisten Genomdatenbanken, und ein einzelnes Sequenzergebnis bietet dem Datenbankbenutzer auch nützliche Links für genetische Informationen.Neben Informationen zu einer bestimmten Sequenz bieten viele Datenbanken eine visuelle Darstellung der Sequenz und der bemerkenswerten Merkmale dieses Bereichs.

Unterschiedliche Organismen können spezifische Genomdatenbanken haben, aber einige größere Datenbanken enthalten mehr als eine Art.Verschiedene Behörden steuern die verschiedenen verfügbaren Datenbanken, sodass die Datenbanken unterschiedliche Formate und Suchfunktionen verwenden können.Einige Beispiele dieser Behörden sind das NCBI, das Europäische Bioinformatikinstitut oder sogar einzelne Universitäten.