Ano ang isang database ng genome?

Ang isang genome ay isang koleksyon ng lahat ng genetic material na naroroon sa isang organismo.Habang ang pagkakasunud -sunod at istraktura ng materyal na genetic na ito ay nagtutulak ng lahat ng biological life, ang mga siyentipiko ay interesado na malaman kung ano ang kanilang lahat.Ang isang database ng genome ay isang koleksyon ng cross-referenced ng impormasyon tungkol sa isa o higit pang mga organismo, kaya ang isang siyentipiko ay maaaring tumingin sa lahat ng magagamit na impormasyon ng genetic upang matulungan siya sa pananaliksik.ng impormasyon.Samakatuwid, ang mga computer na database, ay ang tanging praktikal na paraan ng pag -aayos ng mga detalye sa isang lugar.Kadalasan, ang mga ito ay magagamit bilang mga online database para sa pang -agham na pananaliksik.Ang isang medyo bagong larangan ng agham, na tinatawag na

bioinformatics,

ay umusbong upang maperpekto ang paraan ng biological data ay maaaring bigyang kahulugan sa pamamagitan ng mga computer system. Ang mga database ng mga genomes ay naglalaman ng pagkakasunud -sunod ng mga gene ng isang organismo kung ang buong pagkakasunud -sunod ay kilala.Kung hindi man, maaari itong maglaman ng mga bahagyang pagkakasunud -sunod.Ang tao, mouse, at

Drosophila

fly genomes ay sunud -sunod, halimbawa.Kapag ang pagkakasunud -sunod ng isang genome ay kilala, ang mga geneticist ay maaaring makilala ang mga partikular na gen sa genome.Ang bawat gene ay ang sheet ng pagtuturo para sa isang partikular na produkto ng cell. Kung ang isang gene ay may mutation, mayroon itong ibang pagkakasunud -sunod sa normal, functional gene.Ang mga mutasyon ay maaaring maging kapaki -pakinabang at makagawa ng isang kapaki -pakinabang na katangian sa mutated organismo.Hindi rin sila makakagawa ng pagkakaiba sa produkto, o maaari silang makapinsala sa mga normal na gawa ng organismo.Maraming mga kondisyong medikal, halimbawa, ay dahil sa mga mutasyon sa isang partikular na gene.

Ang mga mutasyon ay maaari ding magamit upang makalkula kung gaano kalapit ang nauugnay sa isang partikular na species sa isa pa, dahil mas maraming mga mutation na naipon sa paglipas ng panahon.Ang mga indibidwal ay maaari ring mag -iba sa pagkakasunud -sunod ng genome, lalo na bilang mga malalaking bahagi ng genome ay hindi mga gene at hindi code para sa anumang mahahalagang produkto ng cell.Ang isang database ng genome ay may hawak na pagkakasunud -sunod mula sa isang organismo na itinalaga bilang isang pamantayan, ngunit maraming mga menor de edad na pagkakaiba sa mga di -makatwirang napiling pamantayan at ang iba pang mga indibidwal sa isang species.

Sa kabila ng pagkakaroon ng maraming pagkakaiba -iba, ang mga gene ay nakikilala sa pamamagitan ng mga pagkakasunud -sunod.Kung alam ng mga geneticist kung ano ang ginagawa ng isang partikular na gene sa isang organismo, kung gayon ang isang gene na may katulad na pagkakasunud -sunod sa isa pang hayop na marahil ay gumaganap ng parehong pag -andar.Ang mga geneticist ay maaaring gumamit ng isang genome database alinman upang makilala ang isang gene na pinag -aaralan nila o upang malaman kung ano ang ginagawa ng gene.

Ang bawat database ng genome ay mahahanap.Karaniwan, ang mga siyentipiko ay maaaring maghanap ng isang database ng isa sa maraming iba't ibang mga paraan.Karaniwan, maaari niyang i -input ang pagkakasunud -sunod ng isang gene na kanyang sunud -sunod.Pagkatapos, ang database ay nakakahanap ng isa o higit pang mga katulad na pagkakasunud -sunod para sa paghahambing.

Ang isang mas simpleng paraan ng paghahanap ng database ay nagsasangkot ng paghahanap ng isang susi ng gene, tulad ng pangalan ng gene.Ang mga awtoridad tulad ng U.S. National Authority for Biotechnology Information (NCBI) ay maaaring magbigay ng mga pagkakasunud -sunod na mga numero ng sanggunian, at ang isang geneticist ay maaari ring maghanap ng isang database ng genome gamit ang isa sa mga pagkakakilanlan na ito.Maaari rin niyang paliitin ang mga resulta gamit ang mas maraming mga parameter ng paghahanap.Ang impormasyon na na-cross-referenced ay isang tampok ng karamihan sa mga database ng genome, at ang isang solong resulta ng pagkakasunud-sunod ay magkakaloob din ng gumagamit ng database na may kapaki-pakinabang na mga link para sa higit pang impormasyon sa genetic.Pati na rin ang impormasyon tungkol sa isang tiyak na pagkakasunud -sunod, maraming mga database ang nagbibigay ng isang visual na representasyon ng pagkakasunud -sunod at ng mga kilalang tampok ng lugar na iyon.

Ang iba't ibang mga organismo ay maaaring magkaroon ng mga tiyak na database ng genome, ngunit ang ilang mas malaking database ay naglalaman ng higit sa isang species.Kinokontrol ng iba't ibang mga awtoridad ang iba't ibang mga database na magagamit, kaya ang lahat ay maaaring gumamit ng mga natatanging format at mga kakayahan sa paghahanap.Ang ilang mga halimbawa ng mga awtoridad na ito ay kasama ang NCBI, ang European Bioinformatics Institute, o kahit na mga indibidwal na unibersidad.