Cơ sở dữ liệu bộ gen là gì?

Một bộ gen là một tập hợp của tất cả các vật liệu di truyền có trong một sinh vật.Khi trình tự và cấu trúc của vật liệu di truyền này thúc đẩy tất cả cuộc sống sinh học, các nhà khoa học rất quan tâm đến việc tìm hiểu tất cả những gì chúng để làm.Cơ sở dữ liệu bộ gen là một tập hợp thông tin tham chiếu chéo về một hoặc nhiều sinh vật, vì vậy một nhà khoa học có thể xem xét tất cả các thông tin di truyền có sẵn để giúp anh ấy hoặc cô ấy nghiên cứu.của thông tin.Do đó, cơ sở dữ liệu được vi tính hóa là cách thực tế duy nhất để tổ chức các chi tiết ở một nơi.Nói chung, chúng có sẵn dưới dạng cơ sở dữ liệu trực tuyến cho nghiên cứu khoa học.Một lĩnh vực khoa học tương đối mới, được gọi là

tin sinh học, đã xuất hiện để hoàn thiện cách giải thích dữ liệu sinh học thông qua các hệ thống máy tính. Cơ sở dữ liệu của bộ gen chứa chuỗi các gen của một sinh vật nếu biết toàn bộ chuỗi.Nếu không, nó có thể chứa các chuỗi một phần.Ví dụ, bộ gen của con người, chuột và

Drosophila đã được giải trình tự.Khi trình tự của một bộ gen được biết đến, các nhà di truyền học có thể xác định các gen cụ thể trong bộ gen.Mỗi gen là bảng hướng dẫn cho một sản phẩm tế bào cụ thể.Nếu một gen có đột biến, nó có một chuỗi khác với gen chức năng bình thường.Đột biến có thể có lợi và tạo ra một đặc tính hữu ích trong sinh vật đột biến.Chúng cũng có thể không có sự khác biệt nào đối với sản phẩm, hoặc chúng có thể gây bất lợi cho hoạt động bình thường của sinh vật.Nhiều điều kiện y tế, ví dụ, là do đột biến trong một gen cụ thể.Đột biến cũng có thể được sử dụng để tính toán mức độ liên quan chặt chẽ của một loài với một loài khác, vì nhiều đột biến tích lũy theo thời gian.Các cá nhân cũng có thể thay đổi theo trình tự bộ gen, đặc biệt là các phần lớn của bộ gen không phải là gen và không mã hóa cho bất kỳ sản phẩm tế bào thiết yếu nào.Một cơ sở dữ liệu bộ gen giữ một chuỗi từ một sinh vật được chỉ định là một tiêu chuẩn, nhưng sẽ có nhiều khác biệt nhỏ giữa tiêu chuẩn được lựa chọn tùy ý và các cá thể khác trong một loài.Mặc dù có sự hiện diện của nhiều sự khác biệt, gen có thể nhận ra thông qua các chuỗi.Nếu các nhà di truyền học biết những gì một gen cụ thể làm trong một sinh vật, thì một gen có trình tự tương tự ở một động vật khác có thể thực hiện cùng một chức năng.Các nhà di truyền học có thể sử dụng cơ sở dữ liệu bộ gen để xác định một gen mà họ đang nghiên cứu hoặc để tìm hiểu những gì gen làm.Mỗi cơ sở dữ liệu bộ gen có thể tìm kiếm được.Thông thường, các nhà khoa học có thể tìm kiếm một cơ sở dữ liệu một trong nhiều cách khác nhau.Thông thường, anh ta hoặc cô ta có thể nhập chuỗi một gen mà anh ta hoặc cô ta đã giải trình tự.Sau đó, cơ sở dữ liệu tìm thấy một hoặc nhiều chuỗi tương tự để so sánh.Một cách đơn giản hơn để tìm kiếm cơ sở dữ liệu liên quan đến việc tìm kiếm một từ khóa gen, chẳng hạn như tên của gen.Các nhà chức trách như Cơ quan Thông tin Công nghệ Sinh học Quốc gia Hoa Kỳ (NCBI) có thể cung cấp các chuỗi tham chiếu riêng biệt và một nhà di truyền học cũng có thể tìm kiếm cơ sở dữ liệu bộ gen bằng cách sử dụng một trong những định danh này.Anh ấy hoặc cô ấy cũng có thể thu hẹp kết quả bằng cách sử dụng nhiều thông số tìm kiếm hơn.Thông tin tham chiếu chéo là một tính năng của hầu hết các cơ sở dữ liệu bộ gen và một kết quả trình tự duy nhất cũng sẽ cung cấp cho người dùng cơ sở dữ liệu với các liên kết hữu ích để biết thêm thông tin di truyền.Cũng như thông tin về một chuỗi cụ thể, nhiều cơ sở dữ liệu cung cấp một biểu diễn trực quan về trình tự và các tính năng đáng chú ý của khu vực đó.Các sinh vật khác nhau có thể có cơ sở dữ liệu bộ gen cụ thể, nhưng một số cơ sở dữ liệu lớn hơn chứa nhiều hơn một loài.Các cơ quan khác nhau kiểm soát các cơ sở dữ liệu khác nhau có sẵn, vì vậy tất cả các cơ sở dữ liệu đều có thể sử dụng các định dạng và khả năng tìm kiếm riêng biệt.Một số ví dụ về các cơ quan này bao gồm NCBI, Viện tin sinh học châu Âu hoặc thậm chí các trường đại học cá nhân.