Apa itu database genome?

Sebuah genom adalah kumpulan dari semua bahan genetik yang ada dalam satu organisme.Karena urutan dan struktur materi genetik ini mendorong semua kehidupan biologis, para ilmuwan sangat tertarik untuk mencari tahu untuk apa mereka semua.Basis data genom adalah kumpulan informasi yang dirujuk silang tentang satu atau lebih organisme, sehingga seorang ilmuwan dapat melihat semua informasi genetik yang tersedia untuk membantunya dalam penelitian.

Genom sangat kompleks dan mengandung miliaran basis dalam urutannyainformasi.Database yang terkomputerisasi, oleh karena itu, adalah satu -satunya cara praktis untuk mengatur detail di satu tempat.Secara umum, ini tersedia sebagai basis data online untuk penelitian ilmiah.Bidang sains yang relatif baru, yang disebut bioinformatika, telah bermunculan untuk menyempurnakan cara data biologis dapat ditafsirkan melalui sistem komputer.

Basis data genom berisi urutan gen suatu organisme jika seluruh urutan diketahui.Jika tidak, ia dapat berisi urutan parsial.Genom lalat manusia, tikus, dan Drosophila telah diurutkan, misalnya.Ketika urutan genom diketahui, ahli genetika dapat mengidentifikasi gen tertentu dalam genom.Setiap gen adalah lembar instruksi untuk satu produk sel tertentu.

Jika suatu gen memiliki mutasi, ia memiliki urutan yang berbeda dengan gen fungsional normal.Mutasi dapat bermanfaat dan menghasilkan karakteristik yang bermanfaat dalam organisme bermutasi.Mereka juga tidak dapat membuat perbedaan pada produk, atau mereka dapat merugikan pekerjaan normal organisme.Banyak kondisi medis, misalnya, disebabkan oleh mutasi pada gen tertentu.

Mutasi juga dapat digunakan untuk menghitung seberapa erat terkait spesies tertentu dengan yang lain, karena lebih banyak mutasi terakumulasi dari waktu ke waktu.Individu juga dapat bervariasi dalam urutan genom, terutama karena sebagian besar genom bukanlah gen dan tidak kode untuk produk sel penting apa pun.Basis data genom memiliki urutan dari organisme yang ditetapkan sebagai standar, tetapi akan ada banyak perbedaan kecil di antara standar yang dipilih secara sewenang -wenang dan orang lain dalam suatu spesies.

Meskipun ada banyak perbedaan, gen dapat dikenali melalui urutan.Jika ahli genetika tahu apa yang dilakukan gen tertentu dalam satu organisme, maka gen dengan urutan yang sama pada hewan lain yang paling mungkin melakukan fungsi yang sama.Ahli genetika dapat menggunakan database genom baik untuk mengidentifikasi gen yang mereka pelajari atau untuk mengetahui apa yang dilakukan gen tersebut.

Setiap database genom dapat dicari.Biasanya, para ilmuwan dapat mencari database salah satu dari beberapa cara berbeda.Umumnya, ia dapat memasukkan urutan gen yang telah diurutkannya.Kemudian, database menemukan satu atau lebih urutan serupa untuk perbandingan.

Cara yang lebih sederhana dalam mencari database melibatkan mencari kata kunci gen, seperti nama gen.Pihak berwenang seperti Otoritas Nasional AS untuk Informasi Bioteknologi (NCBI) dapat memberikan urutan nomor referensi yang berbeda, dan ahli genetika juga dapat mencari basis data genom menggunakan salah satu pengidentifikasi ini.Ia juga dapat mempersempit hasil menggunakan lebih banyak parameter pencarian.Informasi referensi silang adalah fitur dari sebagian besar database genom, dan hasil urutan tunggal juga akan memberikan pengguna basis data dengan tautan yang berguna untuk informasi genetik yang lebih.Selain informasi tentang urutan tertentu, banyak database memberikan representasi visual dari urutan dan fitur penting dari area tersebut.

Organisme yang berbeda dapat memiliki database genom spesifik, tetapi beberapa database yang lebih besar mengandung lebih dari satu spesies.Berbagai otoritas mengontrol berbagai database yang tersedia, sehingga database semua dapat menggunakan format dan kemampuan pencarian yang berbeda.Beberapa contoh otoritas ini termasuk NCBI, Institut Bioinformatika Eropa, atau bahkan universitas individu.