Mi az a contig?

Egy kontig, rövid, a szomszédos esetben, vagy egy dezoxiribonukleinsav (DNS) szegmensre, vagy az átfedő szegmensek termékére, amelyek folyamatos, kiterjedt, megszakítás nélküli DNS -szekvenciát képeznek.Ezen szegmensek térképeinek tanulmányozásával felfedezhetjük a különféle szekvenciákat tartalmazó szegmensek sorrendjét, és a kontigokat hozzáadhatjuk, eltávolíthatjuk vagy átrendezhetjük, hogy új szekvenciákat képezzenek.A DNS Contig -feltérképezés és a könyvtárak lehetővé teszik a kutatók számára, hogy azonosítsák a betegségeket okozó igazításokat, jobban megértsék, hogyan reagálnak a sejtek bizonyos körülmények között, és lehetővé teszik a kedvező tulajdonságok klónozását az élő szervezetekben.A megfelelő szekvencia -címkék átfedése vagy az kifejezett szekvencia -címkék illesztésével.A DNS -szegmensek alapjai által alkalmazott építőelem -folyamat megértésével a kontigok megismételhetik vagy klónozhatják a kívánt szekvenciákba, hozzáadva vagy eltávolítva a kevésbé kedvező szegmenseket.A kutatók ezeket a szekvenciákat a rendkívül részletes, számítógépes DNS -programok térképeinek tekintik.A program a szegmensek felépítéséhez használt bázisok és az egyes szekvenciák felépítéséhez használt bázisok vizuális bontását biztosítja.Különböző színsémák felhasználásával a különféle Contig programok ezt az információt alacsony, közepes és kiváló minőségű szekvenciákként jelenítik meg.

A Contig térképezése gyakran megvilágítja a genetikai rendellenességek okait.Például a Williams-szindróma multi-rendszer tüneteket okoz a gyermekeknél, ideértve a szív- és érrendszeri problémákat, a megnövekedett vér kalciumszintet és a fejlődés elmulasztását.A kutatók felfedezték az egyes géneket érintő sávdeléciókat, amelyeket a kontigok nem megfelelő átfedése okozhat.Egy másik genetikai gyermekkori rendellenesség, a CRI-Du-Chat-szindróma szintén több tünetet okoz, amelyek mindegyike szerint a tudósok korrelálnak a deléciókkal és a rendellenes pozicionálással.

A kutatók a növényfajok kontig szekvenciáit is elemzik.Mindegyik növény egyedi szekvenálást tartalmaz, és az egyes növényfajok térképeinek beszerzésével a tudósok hasonló és változó tulajdonságokat fedeznek fel, amelyek hozzájárulhatnak egy adott növénytípus egészségéhez vagy romlásához.Az organizmusokat hordozó betegségben lévő kontigszegmensek és szekvenciák elemzésével az orvosok meghatározhatják azokat a tulajdonságokat, amelyek felhasználhatók a kezelés fejlődésében.A feltérképezés vizuális betekintést nyújt a lehetséges genetikai manipulációkba szekvencia -deléciókkal vagy klónozással.

A tudósok klónozott DNS -mintákat termeszthetnek bakteriális mesterséges kromoszómában, élesztő mesterséges kromoszómában, vagy P1 vagy fág mesterséges kromoszóma tápközegben.Ezek a kromoszómák 50 és több százezer bázisban vannak, amelyek összeállítják a kontigszegmenseket.A kolonizációs időszak után a mintákat fecskendővel extraháljuk, és DNS -szekvenáló gélbe helyezzük, amely elektroforézisben és szárításon megy keresztül.Egy autoradiográf elolvassa a mintát, és ujjlenyomatot mutat a szekvenciákkal.A kutatók ezután beolvasják az ujjlenyomatot egy képfájlba, amelyet később be lehet tölteni egy Contig programba.