Ano ang isang contig?

Ang isang contig, maikli para sa magkasalungat, ay tumutukoy sa alinman sa isang deoxyribonucleic acid (DNA) na segment o ang produkto ng overlay na mga segment na bumubuo ng isang tuluy -tuloy, malawak, walang tigil na pagkakasunud -sunod ng DNA.Sa pamamagitan ng pag -aaral ng mga mapa ng mga segment na ito, posible na matuklasan ang pagkakasunud -sunod ng mga segment na binubuo ng iba't ibang mga pagkakasunud -sunod, at ang mga contigs ay maaaring maidagdag, maalis, o muling ayusin upang makabuo ng mga bagong pagkakasunud -sunod.Pinapayagan ng DNA contig mapping at mga aklatan na kilalanin ang mga mananaliksik na maaaring maging sanhi ng sakit, magbigay ng isang mas mahusay na pag -unawa sa kung paano gumanti ang mga cell sa ilalim ng ilang mga kundisyon, at paganahin ang kakayahang i -clone ang mga kanais -nais na katangian sa mga nabubuhay na organismo.Ang pag -overlay ng pagtutugma ng pagkakasunud -sunod na naka -tag na mga set o sa pamamagitan ng pagtutugma ng ipinahayag na mga tag na pagkakasunud -sunod.Sa pamamagitan ng pag -unawa sa proseso ng block block na ginamit ng mga batayan ng mga segment ng DNA, ang mga contigs ay maaaring kopyahin o mai -clone sa kanais -nais na mga pagkakasunud -sunod, pagdaragdag o pagtanggal ng hindi gaanong kanais -nais na mga segment.Tinitingnan ng mga mananaliksik ang mga pagkakasunud -sunod na ito bilang mga mapa sa lubos na detalyado, computerized na mga programa ng DNA.Nagbibigay ang programa ng isang visual breakdown ng mga base na ginamit upang mabuo ang mga segment, at ang mga segment na ginamit upang makabuo ng mga partikular na pagkakasunud -sunod.Gamit ang iba't ibang mga scheme ng kulay, ang iba't ibang mga programa ng CONTIG ay nagpapakita ng impormasyong ito bilang mababa, daluyan, at mataas na kalidad na mga pagkakasunud -sunod.

Ang pagma -map ng contig ay madalas na nagpapagaan sa mga sanhi ng mga sakit sa genetic.Ang Williams syndrome, halimbawa, ay gumagawa ng mga sintomas ng multi-system sa mga bata, kabilang ang mga problema sa cardiovascular, nakataas na antas ng calcium ng dugo, at pagkabigo na umunlad.Natuklasan ng mga mananaliksik ang mga pagtanggal ng banda na nakakaapekto sa ilang mga gene, na maaaring sanhi ng hindi naaangkop na pag -overlay ng mga contigs.Ang isa pang genetic na karamdaman sa pagkabata, ang Cri-du-Chat syndrome, ay gumagawa din ng maraming mga sintomas, na ang bawat isa ay naniniwala na ang mga siyentipiko ay may kaugnayan sa mga pagtanggal at hindi normal na pagpoposisyon.

Sinusuri din ng mga mananaliksik ang mga pagkakasunud -sunod ng contig sa mga species ng halaman.Ang bawat halaman ay naglalaman ng pagkakasunud -sunod na natatangi sa halaman na iyon, at sa pamamagitan ng pagkuha ng mga mapa ng mga indibidwal na species ng halaman, natuklasan ng mga siyentipiko ang magkatulad at iba't ibang mga katangian na maaaring mag -ambag sa kalusugan o pagkasira ng isang partikular na uri ng halaman.Sa pamamagitan ng pagsusuri ng mga segment ng contig at mga pagkakasunud -sunod sa sakit na nagdadala ng mga organismo, ang mga manggagamot ay maaaring matukoy ang mga katangian na maaaring magamit sa pag -unlad ng paggamot.Nagbibigay ang pagmamapa ng visual na pananaw sa mga posibleng pagmamanipula ng genetic sa pamamagitan ng mga pagtanggal ng pagkakasunud -sunod o pag -clone.

Ang mga siyentipiko ay maaaring lumaki ang mga naka -clone na mga sample ng DNA sa bakterya artipisyal na kromosoma, lebadura artipisyal na kromosoma, o sa P1 o phage artipisyal na chromosome media.Ang mga kromosom na ito ay naglalaman ng kahit saan mula 50 hanggang daan -daang libong mga base, na pinagsama ang mga segment ng contig.Matapos ang isang panahon ng kolonisasyon, ang mga sample ay nakuha gamit ang isang syringe at inilagay sa DNA na pagkakasunud -sunod ng gel, na sumasailalim sa electrophoresis at dries.Binabasa ng isang autoradiograph ang sample at mga fingerprint ang mga pagkakasunud -sunod.Pagkatapos ay i -scan ng mga mananaliksik ang fingerprint sa isang file ng imahe, na maaaring kalaunan ay mai -load sa isang programa ng CONTIG.