Apa itu contig?

Contig, kependekan dari bersebelahan, mengacu pada segmen asam deoksiribonukleat (DNA) atau produk dari segmen yang tumpang tindih yang membentuk urutan DNA yang kontinu, luas, dan tidak terputus.Dengan mempelajari peta segmen -segmen ini, dimungkinkan untuk menemukan urutan segmen yang terdiri dari berbagai urutan, dan contig dapat ditambahkan, dihapus, atau diatur ulang untuk membentuk urutan baru.Pemetaan DNA Contig dan perpustakaan memungkinkan para peneliti untuk mengidentifikasi keberpihakan yang dapat menyebabkan penyakit, memberikan pemahaman yang lebih baik tentang bagaimana sel -sel bereaksi dalam kondisi tertentu, dan memungkinkan kemampuan untuk mengkloning karakteristik yang menguntungkan dalam organisme hidup.

Contig genom terhubung satu sama lain oleh satu sama lain olehTumpang tindih dari set yang cocok dengan tag atau dengan mencocokkan tag urutan yang diekspresikan.Dengan memahami proses blok bangunan ini yang digunakan oleh basis segmen DNA, contig dapat direplikasi atau dikloning ke dalam urutan yang diinginkan, menambah atau menghilangkan segmen yang kurang menguntungkan.Para peneliti melihat urutan ini sebagai peta pada program DNA yang sangat rinci dan terkomputerisasi.Program ini memberikan rincian visual dari basis yang digunakan untuk membangun segmen, dan segmen yang digunakan untuk membangun urutan tertentu.Menggunakan skema warna yang berbeda, berbagai program contig menampilkan informasi ini sebagai urutan rendah, sedang, dan berkualitas tinggi.

Contig Mapping sering menjelaskan penyebab gangguan genetik.Sindrom Williams, misalnya, menghasilkan gejala multi-sistem pada anak-anak, termasuk masalah kardiovaskular, peningkatan kadar kalsium darah, dan kegagalan untuk berkembang.Para peneliti menemukan penghapusan pita yang mempengaruhi gen tertentu, yang mungkin disebabkan oleh tumpang tindih yang tidak tepat dari contigs.Gangguan anak-anak genetik lainnya, sindrom CRI-DU-CHAT, juga menghasilkan banyak gejala, yang masing-masing para ilmuwan yakini berkorelasi dengan penghapusan dan penentuan posisi yang tidak normal.

Peneliti juga menganalisis urutan contig pada spesies tanaman.Setiap tanaman mengandung pengurutan yang unik untuk tanaman itu, dan dengan mendapatkan peta spesies tanaman individu, para ilmuwan menemukan karakteristik yang serupa dan beragam yang dapat berkontribusi pada kesehatan atau kerusakan jenis tanaman tertentu.Dengan menganalisis segmen dan urutan contig dalam organisme yang membawa penyakit, dokter dapat menentukan sifat -sifat yang kemudian dapat digunakan dalam pengembangan pengobatan.Pemetaan memberikan wawasan visual tentang kemungkinan manipulasi genetik melalui penghapusan urutan atau kloning.

Ilmuwan dapat menumbuhkan sampel DNA yang dikloning dalam kromosom buatan bakteri, kromosom buatan ragi, atau di P1 atau media kromosom buatan fag.Kromosom ini mengandung 50 hingga ratusan ribu pangkalan, yang menyusun segmen contig.Setelah periode kolonisasi, sampel diekstraksi menggunakan jarum suntik dan ditempatkan dalam gel sekuensing DNA, yang mengalami elektroforesis dan kering.Autoradiograph membaca sampel dan sidik jari urutannya.Para peneliti kemudian memindai sidik jari ke file gambar, yang kemudian dapat dimuat ke dalam program contig.